原文:(史上最全)SNP位点与转录因子结合特异性数据库:GVATdb

众所周知,全基因组关联分析 GWAS 发现的很多变异位点基本为非编码,这些变异位点 要么调控基因表达 eQTL 要么影响增强子活性 要么影响转录因子 TF 结合特异性 要么啥也不是。 针对以上四种情况: 是否调控基因表达 eQTL 可通过GTEx https: gtexportal.org home 查询。 是否影响增强子活性可通过之前的推文查询:感兴趣的SNP 区域上是否有增强子 转录因子 增强 ...

2021-02-05 20:53 0 550 推荐指数:

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特异性转录组测序

特异性转录组测序 非链特异性转录组测序信息不包含链方向的特征信息,对正义和反义转录本无法准确判断,导致无法反映真实的转录情况。而链特异性转录组测序(strand-specific RNA seq)可以解决这个问题。链特异性的方式是在合成cDNA的第二条链时 ...

Fri Oct 19 19:05:00 CST 2018 0 1741
对链特异性的理解

对链特异性的理解 2018年07月27日 01:21:03 sixu_9days 阅读数:650 标签: 链特异性LncRNA-seq 更多 个人分类: RNA-Seq ...

Thu Oct 18 18:50:00 CST 2018 0 1265
Cistrome数据库挖掘转录因子靶基因 | TF | target

进入http://cistrome.org/db/#/数据库 输入你感兴趣的转录因子,比如HDAC1 选择物种,以及你感兴趣的cell type 点击可以查询”check a putative target“ 也可以下载全部的”Putative Target ...

Thu Apr 01 04:26:00 CST 2021 0 260
 
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