链特异性转录组测序 非链特异性转录组测序信息不包含链方向的特征信息,对正义和反义转录本无法准确判断,导致无法反映真实的转录情况。而链特异性转录组测序(strand-specific RNA seq)可以解决这个问题。链特异性建库的方式是在合成cDNA的第二条链时 ...
众所周知,全基因组关联分析 GWAS 发现的很多变异位点基本为非编码,这些变异位点 要么调控基因表达 eQTL 要么影响增强子活性 要么影响转录因子 TF 结合特异性 要么啥也不是。 针对以上四种情况: 是否调控基因表达 eQTL 可通过GTEx https: gtexportal.org home 查询。 是否影响增强子活性可通过之前的推文查询:感兴趣的SNP 区域上是否有增强子 转录因子 增强 ...
2021-02-05 20:53 0 550 推荐指数:
链特异性转录组测序 非链特异性转录组测序信息不包含链方向的特征信息,对正义和反义转录本无法准确判断,导致无法反映真实的转录情况。而链特异性转录组测序(strand-specific RNA seq)可以解决这个问题。链特异性建库的方式是在合成cDNA的第二条链时 ...
对链特异性建库的理解 2018年07月27日 01:21:03 sixu_9days 阅读数:650 标签: 链特异性建库LncRNA-seq 更多 个人分类: RNA-Seq ...
位点特异性重组 和 DNA转座 视频 https://www.bilibili.com/video/av7973580/ 教材 Molecular biology of the gene 7th edition J.D. Watson et. al 很多重要DNA重排是由两类重要遗传 ...
和MetaXcan工具进行全转录组分析(Transcriptome-Wide Analysis) 该工具最大 ...
https://blog.csdn.net/dgyuanshaofeng/article/details/78686117 Sensitivity,我们常说“敏感性”、“灵敏性”、“召回率”或者“查 ...
进入http://cistrome.org/db/#/数据库 输入你感兴趣的转录因子,比如HDAC1 选择物种,以及你感兴趣的cell type 点击可以查询”check a putative target“ 也可以下载全部的”Putative Target ...
(Sen): Sen=TP/(TP+FN)*100% 特异性 Specificity (Spe) s ...
二、下载对比数据库 下载地址:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast ...