原文:构建一个近乎完整的植物基因组

目录 前言 . 单分子长度长测序 . 长度长基因组组装的错误倾向 . 物理图谱技术 . 解决复杂植物基因组 . 利用组装图 挑战和展望 前言 植物基因组大小跨越几个数量级,倍性和杂合性变化,以及新旧基因组转座子变化等带来组装挑战。三代和物理图谱提供了新机会,单倍型定相 结构变异分析 从头泛基因组研究成为新兴组装热点。 植物基因组发展: 拟南芥:sanger BAC by BAC。 shotgun ...

2021-02-02 20:08 0 330 推荐指数:

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动物基因组植物基因组基本差异

植物vs动物总结版: 简述高等植物基因组(可以以拟南芥和水稻基因组为例)与高等动物基因组(可以以人类、果蝇等基因组为例)在基因结构层面展示出来的基本差异。 高等植物基因组与高等动物基因组基因结构上的基本差异主要是生命学的第一困境,即复制-转录负载困境。 机制: 1.从平衡流 ...

Fri Dec 20 00:01:00 CST 2019 0 1047
综述:如何研究植物基因组DNA羟甲基化(5hmC)?|易基因

大家好,这里是专注表观学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 概述: 基因表达模式的变化可能是由于在DNA序列不变的情况下基因组发生的修饰而引起的; 这些修饰包括胞嘧啶甲基化生成5-甲基胞嘧啶(5mC),从而产生可遗传的表观突变和新的表观等位基因。这种类型的非序列变异称为表观遗传学 ...

Tue Apr 12 22:28:00 CST 2022 0 617
参考基因组

参考基因组版本命名参考基因组联盟(Genome Reference Consortium),它是由 NCBI,EBI,桑格研究所等机构组成。GRC 利用最佳的技术装配,纠正,增加基因组序列,以此作为在生信分析领域作为参考的基因组。人基因组官名叫 GRCh38 (Genome ...

Sat Jun 12 20:52:00 CST 2021 0 1267
基因组注释

基因组注释主要包括四个研究方向:重复序列的识别;非编码RNA的预测;基因结构预测和基因功能注释。我们将分别对这四个领域进行阐述。 1 重复序列的识别。 1.1 重复序列的研究背景和意义:重复序列可分为串联重复序列(Tendam repeat)和散在重复序列 ...

Mon Jan 11 19:48:00 CST 2016 0 4001
 
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