如何计算每个基因的覆盖度与深度
如何计算每个基因的覆盖度与深度，有多种方法可以完成。如下演示使用samtools depth命令方法 1. 数据下载 1.1 Fastq文件下载 从NCBI下载Illumina Hiseq X Ten平台的RNA-Seq数据SRR7751429信息如上图所示。 1.1.1 ...
原文：Bedtools genomecov 计算覆盖度
简单说明： 从 . . 版开始，bedtools使用htslib库支持CRAM格式 除了BAM文件，bedtools默认所有的输入文件都以TAB键分割 除非使用 sorted选项，bedtools默认不支持大于 M的染色体 如果没有使用 sorted参数对染色体按编码顺序进行排序 e.g., sort k , k , n ，则必须使用 g参数输入相同排序染色体 bedtools要求染色体命名方案在 ...
2021-01-09 11:14 0 1029 推荐指数：
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