原文:代谢组学实验、质控与分析

目录 .实验及质控 项目流程 非靶代谢质控 靶向代谢质控 代谢组全流程质控 .数据分析挖掘 代谢组分类回顾 数据预处理 定量层面挖掘 功能层面挖掘 .实验及质控 项目流程 代谢组学分析的特点: 流程长 样品量大,项目周期长 个体差异大 设备不稳定性 样品复杂,基质效应显著。 所以,质量控制是代谢组学研究基础。 项目流程 样本制备 质谱仪分析 数据预处理 定量及统计分析 定性分析 生信及后续分析 ...

2020-12-30 11:54 0 773 推荐指数:

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蛋白质实验设计、质控分析

1. 实验设计与技术路线 (1) 常用流程 流程 说明 1.材料收集 细胞、细胞上清、组织、血浆、血清、脑脊液、外泌体、尿液...... 2.定量技术 蛋白:iTRAQ/TMT ...

Thu Jan 16 05:19:00 CST 2020 0 2942
代谢】5.功能分析

目的 和转录或蛋白分析原理类似,目的是: 将大量的差异代谢物降维到少量的显著富集的代谢通路,方便解释科学问题; 从通路水平上可以更好解释表型背后的生物原理/过程。 富集分析方法 富集分析的本质:某个代谢通路在不同的状态下(如疾病与健康)是否发生了显著变化? ORA富集 回答的问题 ...

Thu Jan 16 05:54:00 CST 2020 0 1747
代谢】5.功能分析

目录 目的 富集分析方法 ORA富集 FCS富集 工具 目的 和转录或蛋白分析原理类似,目的是: 将大量的差异代谢物降维到少量的显著富集的代谢通路,方便解释科学问题; 从通路水平上可以更好解释表型背后的生物原理 ...

Wed Dec 30 19:52:00 CST 2020 0 429
代谢】3.数据分析

非靶向代谢实验设计 1.代谢物提取,一般要求每组至少10个样; 2.在所有提取好的样本中取等量混合作为QC; 3.QC样本与实验样本穿插上机,开始十个QC,结尾三个QC,中间每十个样本穿插一个QC样本 。 得到质谱谱图数据经软件处理后得到峰表。 峰表格式一般为:每行为一个m/z,每列为一个样 ...

Mon Dec 30 06:35:00 CST 2019 0 5963
代谢】4.生物标志物分析

概念 生物标志物,即传说中的biomarker,是一类可测量的,用来表征疾病状态的物质,通常用于表征: 疾病的状态(是否为某种疾病/某种亚型); 药物敏感性,用于用药指导; 生理状态 ...

Fri Jan 03 06:35:00 CST 2020 0 3626
代谢】3.数据分析

目录 非靶向代谢实验设计 数据分析流程 1.数据预处理 2.数据质控 3.统计分析 非靶向代谢实验设计 1.代谢物提取,一般要求每组至少10个样; 2.在所有提取好的样本中取等量混合作为QC; 3.QC样本与实验 ...

Wed Dec 30 19:49:00 CST 2020 0 1297
代谢】4.生物标志物分析

目录 概念 类型 效果评价 多变量ROC分析 验证 分析工具 概念 生物标志物,即传说中的biomarker,是一类可测量的,用来表征疾病状态的物质,通常用于表征: 疾病的状态(是否为某种疾病/某种亚型); 药物敏感性,用于用药 ...

Wed Dec 30 19:51:00 CST 2020 0 619
代谢分析

综述文章 标准数据 流程样例 & 实用工具 MetaboAnalyst的多组学分析 代谢数据质量评估 主成分分析(PCA) PLS-DA/OPLS-DA二维图 数据归一化分析 ...

Tue Jun 08 00:34:00 CST 2021 0 993
 
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