目的 和转录组或蛋白组的分析原理类似,目的是: 将大量的差异代谢物降维到少量的显著富集的代谢通路,方便解释科学问题; 从通路水平上可以更好解释表型背后的生物学原理/过程。 富集分析方法 富集分析的本质:某个代谢通路在不同的状态下(如疾病与健康)是否发生了显著变化? ORA富集 回答的问题 ...
目录 目的 富集分析方法 ORA富集 FCS富集 工具 目的 和转录组或蛋白组的分析原理类似,目的是: 将大量的差异代谢物降维到少量的显著富集的代谢通路,方便解释科学问题 从通路水平上可以更好解释表型背后的生物学原理 过程。 富集分析方法 富集分析的本质:某个代谢通路在不同的状态下 如疾病与健康 是否发生了显著变化 ORA富集 回答的问题:一个代谢物集合 如某个代谢通路 中所包含的差异代谢物的数 ...
2020-12-30 11:52 0 429 推荐指数:
目的 和转录组或蛋白组的分析原理类似,目的是: 将大量的差异代谢物降维到少量的显著富集的代谢通路,方便解释科学问题; 从通路水平上可以更好解释表型背后的生物学原理/过程。 富集分析方法 富集分析的本质:某个代谢通路在不同的状态下(如疾病与健康)是否发生了显著变化? ORA富集 回答的问题 ...
(4)功能层面挖掘 1.实验及质控 (1)项目流程 代谢组学分析的特点: ...
非靶向代谢组实验设计 1.代谢物提取,一般要求每组至少10个样; 2.在所有提取好的样本中取等量混合作为QC; 3.QC样本与实验样本穿插上机,开始十个QC,结尾三个QC,中间每十个样本穿插一个QC样本 。 得到质谱谱图数据经软件处理后得到峰表。 峰表格式一般为:每行为一个m/z,每列为一个样 ...
概念 生物标志物,即传说中的biomarker,是一类可测量的,用来表征疾病状态的物质,通常用于表征: 疾病的状态(是否为某种疾病/某种亚型); 药物敏感性,用于用药指导; 生理状态 ...
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目录 概念 类型 效果评价 多变量ROC分析 验证 分析工具 概念 生物标志物,即传说中的biomarker,是一类可测量的,用来表征疾病状态的物质,通常用于表征: 疾病的状态(是否为某种疾病/某种亚型); 药物敏感性,用于用药 ...
综述文章 标准数据 流程样例 & 实用工具 MetaboAnalyst的多组学分析 代谢组学数据质量评估 主成分分析(PCA) PLS-DA/OPLS-DA二维图 数据归一化分析 ...
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