目录 1. 理论 2. 实操 2.1 rrBLUP包简介 2.2 实操 3. 补充说明 关于模型 关于交叉验证 参考资料 1. 理论 rrBLUP是基因组选择最常用的模型之一,也是间接 ...
目录 简介 GS示例代码 简介 R包sommer内置了C ,运算速度还是比较快的,功能也很丰富,可求解各种复杂模型。语法相比于lme 包也要好懂一些。 建议查看文档:vignette v .sommer.quick.start 混合线性模型关键在于协方差结构的建立,有以下几类: 复合对称 Compound Symmetry,CS ,所有方差相等,所有协方差也相等,对应于单变量方法。但是对于不同尺 ...
2020-12-29 16:10 0 484 推荐指数:
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目录 1. GS/GP在植物育种中的角色 2. GP模型应用 3. GP模型的准确性 4. 植物育种的GS展望 5. 小结 Genomic SelectioninPlant Breeding: Methods,Models ...
全基因组选择(Genomic selection, GS)是一种利用覆盖全基因组的高密度标记进行选择育种的新方法,可通过早期选择缩短世代间隔,提高育种值(Genomic Estimated Breeding Value, GEBV)估计准确性等加快遗传进展,尤其对低遗传力、难测定的复杂性状具有较好 ...
目录 说明 1.前言 2.植物GS瓶颈 3.提高GS预测的准确性 4.GS与现代育种技术结合 5.GS开源育种网络 说明 Enhancing Genetic Gain through Genomic Selection: From ...
目录 1. 免费开源包/库 1.1 R包 1.2 Python库 2. 成熟软件 3. WEB/GUI工具 前面我们已经介绍了基因组选择的各类模型,今天主要来了解一下做GS有哪些可用的软件和工具。基因组选择处在热门研究阶段 ...
目录 1. 优势杂交育种预测 2. GS育种原理与模型算法 岭回归和LASSO回归 贝叶斯方法 GBLUP和RRBLUP 偏最小二乘法 支持向量机/支持向量回归 其他方法 3. 模型预测能力验证 ...