原文:【GS模型】使用R包sommer进行基因组选择的GBLUP和RRBLUP分析?

目录 简介 GS示例代码 简介 R包sommer内置了C ,运算速度还是比较快的,功能也很丰富,可求解各种复杂模型。语法相比于lme 包也要好懂一些。 建议查看文档:vignette v .sommer.quick.start 混合线性模型关键在于协方差结构的建立,有以下几类: 复合对称 Compound Symmetry,CS ,所有方差相等,所有协方差也相等,对应于单变量方法。但是对于不同尺 ...

2020-12-29 16:10 0 484 推荐指数:

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GS模型】全基因组选择rrBLUP

目录 1. 理论 2. 实操 2.1 rrBLUP简介 2.2 实操 3. 补充说明 关于模型 关于交叉验证 参考资料 1. 理论 rrBLUP基因组选择最常用的模型之一,也是间接 ...

Thu Dec 10 01:01:00 CST 2020 0 948
基因组选择育种(GS)简介

基因组选择(Genomic selection, GS)是一种利用覆盖全基因组的高密度标记进行选择育种的新方法,可通过早期选择缩短世代间隔,提高育种值(Genomic Estimated Breeding Value, GEBV)估计准确性等加快遗传进展,尤其对低遗传力、难测定的复杂性状具有较好 ...

Wed May 13 23:46:00 CST 2020 0 8069
【百奥云GS专栏】全基因组选择之工具篇

目录 1. 免费开源/库 1.1 R 1.2 Python库 2. 成熟软件 3. WEB/GUI工具 前面我们已经介绍了基因组选择的各类模型,今天主要来了解一下做GS有哪些可用的软件和工具。基因组选择处在热门研究阶段 ...

Wed Feb 10 23:44:00 CST 2021 0 480
 
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