单细胞分析实录(2): 使用Cell Ranger得到表达矩阵
Cell Ranger是一个“傻瓜”软件，你只需提供原始的fastq文件，它就会返回feature-barcode表达矩阵。为啥不说是gene-cell，举个例子，cell hashing数据得到的矩阵还有tag行，而列也不能肯定就是一个cell，可能考虑到这个才不叫gene-cell矩阵吧~它是 ...
原文：单细胞分析实录(1): 认识Cell Hashing
这是一个新系列 差不多是一年以前，我定导后没多久，接手了读研后的第一个课题。合作方是医院，和我对接的是一名博一的医学生，最开始两边的老师很排斥常规的单细胞文章思路，即各大类细胞分群 注释 描述，所以起初的几个月都在摸索一条主线，再后来有主线了，要加实验验证，周期有点长。我这边的分析基本做完。读研生活还在继续，我也不能太在意这一个课题，尽管有些时候我也很着急，尽管我在这个课题上花了很多时间。整理分析 ...
2020-12-28 14:10 0 401 推荐指数：
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