scRNA-seq单细胞测序数据分析工具汇总
本文总结自一篇综述： Computational approaches for interpreting scRNA-seq data 单细胞分析分为两个层次： cell level gene level Tools for the visualization ...
原文：scRNA-seq数据获得（R包scRNAseq）
R bioconductor中的scRNAseq数据包是专门提供scRNA seq数据的包。 .Introduction scRNA seq包提供了一个方便的途径来获得公开的数据集，这些数据集是以SingleCellExperiment 格式存储的。 查看表达数据矩阵： . Available data sets 可获得的数据集可以分为两类，第一类包含表达矩阵，由scRNAseq作者从每个实验得到 ...
2021-01-06 17:21 0 629 推荐指数：
相关推荐
单细胞空间转录组 | scRNA-seq
实验室马上要开始做heart的单细胞空间转录组，需要提前了解一下基本的data。 废话不多说，先把示例数据和教程跑一遍，找找感觉。 参考：Seurat4.0系列教程22：空间转录组的分析、可视化与整合 样本制备 - 获取高质量数据的前提 参考 ...
单细胞转录组测序技术(scRNA-seq)及细胞分离技术分类汇总
单细胞测序流程(http://learn.gencore.bio.nyu.edu) 在过去的十多年里，高通量测序技术被广泛应用于生物和医学的各种领域，极大促进了相关的研究和应用。其中转录组测序（RNA-seq）被广泛应用于测定和描绘各类物种的基因或转录 ...
R语言seq()函数用法
1、seq() 用来生成一组数字的函数。 Usage： ## Default S3 method:seq(from = 1, to = 1, by = ((to - from)/(length.out - 1)),length.out = NULL, along.with = NULL ...
R自带数据包
datasets（R自带数据包） 作者：王彦博 作品来源：百度百科 precip #长度为70的命名向量 euro #欧元汇率，长度为11，每个元素都有命名 landmasses #48个陆地的面积，每个都有命名 rivers #北美141条河流长度 state.abb #美国50 ...
[转]Wireshark抓包工具--TCP数据包seq ack等解读
/ ---------------------------------------------------------------------------------------- 1、Wireshark的数据包详情窗口，如果是用中括号[]括起来的，表示注释，在数据包中不占字节2 ...
R语言-数据整形之plyr包
R语言中plyr包 前言 apply族函数是R语言中很有特色的一类函数，包括了apply、sapply、lapply、tapply、aggregate等等。这一类函数本质上是将数据进行分割、计算和整合。它们在数据分析的各个阶段都有很好的用处。例如在数据准备阶段，我们可以按某个标准将数据分组 ...
R语言-数据整形之dplyr包
R语言dplyr包 前言 2014年刚到, 就在 Feedly 订阅里看到 RStudio Blog 介绍 dplyr 包已发布 (Introducing dplyr)， 此包将原本 plyr 包中的 ddply() 等函数进一步分离强化， 专注接受dataframe对象， 大幅提高了速度 ...