post-GWAS：使用coloc进行共定位分析(Colocalization)
GWAS找到显著信号位点后，需要解释显著信号位点如何影响表型。 常见的一个解释方法是共定位分析。 主流的共定位分析包括： 1）GWAS和eQTL共定位； 2）GWAS和sQTL共定位； 3）GWAS和meQTL共定位； 4）GWAS和pQTL共定位； 其中，GWAS ...
原文：Post-GWAS: eQTL、mQTL共定位分析(Summary-data-based Mendelian Randomization,SMR)
eQTL mQTL共定位分析的作用 eQTL mQTL共定位分析属于Post GWAS的一项重要工作，旨在GWAS结果的基础上鉴定与表型相关的eQTL和mQTL位点。 传统的GWAS是将全基因组范围内的常见变异进行关联分析，鉴定与表型相关的基因座，但鉴定出来的位点大多数位于基因间隔区，其如何通过基因或者通路影响表型很难被阐述。 基于此，开发了eQTL mQTL共定位分析方法。 其原理是利用已有数 ...
2020-12-18 20:33 0 1079 推荐指数：
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