从零开始学生信-meme的安装和使用
软件：meme-suit 用途：鉴定motif 目的：其实我这里主要是为了使用streme模块（因为sequence number超过50）。 办法： 1. 如果只安装meme，可以直接用conda install -c bioconda meme。 2. 如果需要所有的套件，需要手动 ...
原文：从零开始学生信-orthofinder的安装和使用-基因家族分析
环境变量 注释掉conda ，source .bashrc 因为orthofinder是由python 编写的。 conda install orthofinder 若在上一章之后没有重启的同学请重启后操作。 由于是刚开始搭建，这里没有给orthofinder单独一个环境空间，这一套下来，基本的基因分析软件都安装好了。 包括两两比对软件：blast，diamond。 diamond快，且宣称其方 ...
2020-12-11 20:38 0 1649 推荐指数：
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从零开始学生信-meme的使用
上一章讲了meme的安装，本章进行使用的讲解，需要快捷食用本章节的请关注公众号：生物信息分析学习 meme的使用，网上有很多例子。 1. 网页版：快捷方便，一台电脑同时可以申请运行四个任务。 先进入网站：http://meme-suite.org/tools/streme ...
基因家族分析之同源基因的寻找
Blast进行同源基因的寻找 参考博客： http://boyun.sh.cn/bio/?p=1849 https://www.bioinfo-scrounger.com/archives/673/ 基于蛋白的比对结果，寻找某一个蛋白家族的同源基因，使用如下的参数 ...
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1. 数据库的配置 OrthoMCL的分析需要先行建立mysql账户并建立相应的数据库。关于mysql ...
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本文为尝试性安装试验，预计耗时30分钟。 ============================================ 怕有什么不靠谱的，先不看别人的博客，直接看GitHub。 $ git clone https://github.com/GMOD/jbrowse.git 官网 ...