【GS模型】使用R包sommer进行基因组选择的GBLUP和RRBLUP分析？
目录 简介 GS示例代码 简介 R包sommer内置了C++，运算速度还是比较快的，功能也很丰富，可求解各种复杂模型。语法相比于lme4包也要好懂一些。 建议查看文档：vignette("v1.sommer.quick.start") 混合线性模型 ...
原文：【GS模型】全基因组选择之rrBLUP
目录 . 理论 . 实操 . rrBLUP包简介 . 实操 . 补充说明 关于模型 关于交叉验证 参考资料 . 理论 rrBLUP是基因组选择最常用的模型之一，也是间接法模型的代表。回顾一下，所谓间接法是指：在参考群中估计标记效应，再结合预测群的基因型信息将标记效应累加，最终获得预测群的个体估计育种值。而直接法则是指：将个体作为随机效应，参考群体和预测群体遗传信息构建的亲缘关系矩阵作为方差协方差 ...
2020-12-09 17:01 0 948 推荐指数：
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全基因组选择（Genomic selection, GS）是一种利用覆盖全基因组的高密度标记进行选择育种的新方法，可通过早期选择缩短世代间隔，提高育种值（Genomic Estimated Breeding Value, GEBV）估计准确性等加快遗传进展，尤其对低遗传力、难测定的复杂性状具有较好 ...
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