基因家族分析之同源基因的寻找
Blast进行同源基因的寻找 参考博客： http://boyun.sh.cn/bio/?p=1849 https://www.bioinfo-scrounger.com/archives/673/ 基于蛋白的比对结果，寻找某一个蛋白家族的同源基因，使用如下的参数 ...
原文：批处理！功能富集分析、基因ID转换、查找同源基因、SNP注释一站式服务
看文献的时候，发现了g:Profiler这个宝藏工具，测试了一下，使用起来超级方便 好用，一定要分享给大家 g:Profiler网址： https: biit.cs.ut.ee gprofiler 下面具体讲一下该网站的功能。 GO 功能富集分析 功能富集分析包括：Gene ontology, biological pathways, regulatory motifs in DNA, prote ...
2020-11-13 19:39 0 664 推荐指数：
相关推荐
SpringBoot一站式启动流程源码分析
一、前言 由上篇文章我们得知，SpringBoot启动时，就是有很简单的一行代码。那我们可以很清楚的看到这行代码的主角便是SpringApplication了，本文我们就来聊一聊这货，来探寻SpringBoot的一站式启动流程。 其实SpringApplication ...
Water 2.4 发布，一站式服务治理平台
Water（水孕育万物...） Water 为项目开发、服务治理，提供一站式解决方案（可以理解为微服务架构支持套件）。基于 Solon 框架开发，并支持完整的 Solon Cloud 规范；已在生产环境跑了4年。 功能约等于：consul + rabbitmq + elk ...
SNPEFF snp注释 (添加自己基因组)
之间介绍过annovar进行对snp注释，今天介绍snpEFF SnpEff is a variant annotation and effect prediction tool. It annotates and predicts the effects of variants ...
一站式WebAPI与认证授权服务
保护WEBAPI有哪些方法？ 微软官方文档推荐了好几个： Azure Active Directory Azure Active Directory B2C (Azure AD B2C) ...
基因id转换
DAVID网站提供了id转换的功能 1 选择上传gene list文件 2 选择上传ID的类型，我们ID-list.txt中的是Ensembl Gene ID，所以这里选ENSEMBL_GENE_ID 3 这个是类型，因为只做ID转换，所以选Gene ...
GSEA-基因集富集分析
Analysis 思路： 使用预定义的基因集（通常来自功能注释或先前实验的结果），将基因按照在两类样本中的差 ...
基因或蛋白富集分析，gsea与ssgsea
大家应该对通路富集分析都很熟悉，如DAVID、超几何富集分析等。都是在大量文章中常见的通路富集方法，给大家介绍一个更加复杂的通路富集分析的前期数据处理包GSVA（gene set variation analysis）与gsea选择。GSVA是一种非参数的无监督分析方法，主要用来评估芯片核转录组 ...