原文:使用GenVisR包进行驱动突变的热图绘制

使用GenVisR包进行驱动突变的热图绘制 介绍 通过热图显示突变的整体情况 代码讲解 加载包,读入数据 它的输入数据 drivers lung.txt 部分如下 代码如下 这里用GenVisR包的waterfall函数进行突变的瀑布图绘制.。mainLabelCol Changep 参数设置格子显示里面的氨基酸变化。mainXlabel T添加x轴样本名字标签。mainPalette custo ...

2020-11-12 22:44 0 446 推荐指数:

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ComplexHeatmap 绘制肿瘤突变分布

来源:https://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/ 安装 7.2 Apply to cBioPortal dataset 通过使用实际数据展示oncoPring()的优势。数据来源于cBioPortal。执行步骤 ...

Wed Sep 11 18:36:00 CST 2019 1 2164
ComplexHeatmap|根据excel表绘制突变景观(oncoplot)

本文首发于“生信补给站”:https://mp.weixin.qq.com/s/8kz2oKvUQrCR2_HWYXQT4g 如果有maf格式的文件,可以直接oncoplot绘制瀑布,有多种展示和统计maftools | 从头开始绘制发表级oncoplot ...

Thu Jun 18 02:51:00 CST 2020 0 896
概率绘制--gradcam

代码展示 Note:我是将自己的网络训练后保存模型,再加载未预训练的Resnet50模型,再加载自己主干网络的参数最后输出提取的特征,这样不用改动太多代码 比较便捷的一点就 ...

Tue Dec 08 07:20:00 CST 2020 1 330
RNA_seq 绘制

若已经拿到表达矩阵exprSet 若差异较大,进行log缩小不同样本的差距 1、全体 2、对差异基因进行绘制,步骤都类似,在进行绘制时,应对数据进行一定处理 3、rlog 进行数据标准化 标准化和raw count ...

Thu Feb 06 06:07:00 CST 2020 0 3588
pheatmap绘制”,你需要的都在这

可以聚合大量的数据,并可以用一种渐进色来优雅地表现,可以很直观地展现数据的疏密程度或频率高低。 本文利用R语言 pheatmap 从头开始绘制各种漂亮的。参数像积木,拼凑出你最喜欢的即可,如下图: 基因和样本都可以单独聚类,排序,聚类再分组,行列注释,配色 ...

Tue Jul 30 21:52:00 CST 2019 0 10680
使用python进行傅里叶变换FFT绘制频谱

频谱的横轴表示的是 频率, 纵轴表示的是振幅 #coding=gbk import numpy as np import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt #依据快速傅里叶算法得到信号的频域 def test_fft ...

Fri Apr 24 00:03:00 CST 2020 0 5735
利用MATLAB绘制矩阵色块

MATLAB自带命令: h = heatmap(XVarNames, XVarNames, R_t) https://ww2.mathworks.cn/help/matlab/ref/heatmap.html 属性控制: https://ww2.mathworks.cn/help ...

Fri Jul 10 19:54:00 CST 2020 0 3003
更新-----为何使用lua进行

  事实上我们在安卓端是可以使用c#jit的,但是我们在ios上的代码是AOT(预先编译,静态编译)的,不能用c# jit(实时编译,即时编译)。   ios不能用c#更是因为启动了CPU的No eXecute bit,简单说就是ios不允许更改代码,更新代码必须重新提安装进行审核 ...

Fri Nov 02 03:21:00 CST 2018 0 2502
 
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