scanpy 单细胞分析包图文详解 01 | 深入理解 AnnData 数据结构
一、环境准备： 搭建 Python 高效开发环境： Pycharm + Anaconda 二、安装 scanpy 三、AnnData 1、AnnData 介绍与结构 AnnData 是用于存储数据的对象，一般作为 scanpy 的数据存储格式。 主要由以下几部分构成 ...
原文：annData格式
.例子 . obs 一维观测的注释，是数据框类型的。通过.运算符访问 访问其中的一个属性，就通过普通的dataframe来访问： . var 一维的针对特征的注释，返回数据框类型。 . uns 无结构的标注，有序字典。 这个uns的部分不是针对行 列的，而是针对行和列标注的参数的 暂时这么理解 ，在上述中pbmc的obs中有louvain观测，那么在uns中就是运行louvain算法的参数。是以 ...
2020-11-11 15:55 0 1050 推荐指数：
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