rMATs是一款分析RNA可变剪切事件的软件,其最大特点是考虑了replicate,还针对配对样本(在医学方面很多都是tumor和normal配对)建立了统计模型,如此以来,得到的结果相对来说也更好。具体可参考文献《rMATS: Robust and flexible detection ...
问题 我在用rMATS turbo做可变剪切分析。然而运行程序发现输出结果文件里只有表头: 解决方法 这个问题在软件github有几个issues提到过类似问题,如 most output files with only a header 说可能是由参数 readLength设置得和实际的read长度不符导致的。加个参数 variable read length即可。 解决方法 根据测序数据正确设 ...
2020-11-10 21:55 0 425 推荐指数:
rMATs是一款分析RNA可变剪切事件的软件,其最大特点是考虑了replicate,还针对配对样本(在医学方面很多都是tumor和normal配对)建立了统计模型,如此以来,得到的结果相对来说也更好。具体可参考文献《rMATS: Robust and flexible detection ...
很简单, 用excel做个合适的表头,然后点击“获取字段”,则界面中获得了整个表头。 在这个界面中复制整个信息表,然后到 csv的输入界面 把字段粘贴上,然后去掉“第一行包含表头”的对勾即可 ...
) """ tf.csv是你当前目录下的csv文件名, names后面是你想要设置的表头内容 , ...
这个神奇的问题困扰了我半天,明明和我之前的写入Excel方法几乎一样,以前可以,这次怎么都不成功,都是只有表头没有数据。 网上也找不到解决方法,反复测试之后终于解决这个坑爹问题,记录一下。如果有人也遇到,可以参考。 直接说结论: 原因是我javabean上用到了@Data注解 ...
这个神奇的问题困扰了我半天,明明和我之前的写入Excel方法几乎一样,以前可以,这次怎么都不成功,都是只有表头没有数据。 网上也找不到解决方法,反复测试之后终于解决这个坑爹问题,记录一下。如果有人也遇到,可以参考。 直接说结论: 原因是我javabean上用到了@Data注解 ...
思路: 1.输出表头文件到指定目录 2.bcp导出csv文件到temp目录 3.将以上导出文件与表头文件合并 4.删除temp目录下的文件 实现: 同理,bat实现与sh实现也一样,我就不写了 。 ...
注:这里说的大文件也不是太大,只有60多M而已(70多万条数据),相对比较大而已。 为了减轻编辑的工作,某种情况下网站上可能用会到csv格式的文件进行数据导入,但一般网站除了有上传文件大小限制以外,还有就是php脚本语言读取文件到内存一些以及写入到mysql中会超过最大范围。因此只 ...
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