TOC Meta-analysis是什么?常用的工具有哪些? 深入Meta-analysis的统计学原理 Meta-analysis实例,输入输出分别是什么? Meta-analysis注意事项,模型选择 关于Meta的在不同场景下的意思 Meta-analysis是什么?常用 ...
下载和安装 从官网 https: genomics.ut.ee en tools gwama download 上下载或: wget http: www.geenivaramu.ee tools sample.zip unzip gwama.zip 解压 make 安装 运行命令: .. GWAMA filelist gwama.in output gwama xp wz jp quantitat ...
2020-11-03 21:04 0 377 推荐指数:
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有很多概念需要明确区分: 人有23对染色体,其中22对常染色体autosome,另外一对为性染色体sex chromosome,XX为女,XY为男。 染色体区带命名:在标示一特定的带时需要包括4项 ...
一、为什么要做GWAS的条件分析(conditional analysis) 我们做GWAS的时候,经常扫出一堆显著的信号,假设rs121是我们扫出来与某表型最显著相关的位点(P=1.351e-36),rs124尾随其后(6.673e-22),也是与该表型显著相关,那么这个时候,我们就有问题 ...
问题: 什么是遗传分析genetic analysis?发展逻辑是什么? 疾病和变 ...
): MAGMA: Generalized gene-set analysis of GWAS data. ...
分析工具 1、叠加分析 2、提取分析 3、统计分析 4、领域分析 ...
为什么需要做meta分析 群体分层是GWAS研究中一个比较常见的假阳性来源. 也就是说,如果数据存在群体分层,却不加以控制,那么很容易得到一堆假阳性位点。 当群体出现分层时,常规手段就是将分层的群体独立分析,最后再做meta分析。 1.如何判断群体是否分层 先用plink计算PCA ...
首先来看一张图: 上面这张神一样的图出自国外一个Lead Performance Engineer(Brendan Gregg)的一次分享,几乎涵盖了一个系统的方方面面,任何人,如果没有完善的计算系统知识,网络知识和操作系统的知识,这张图中列出的工具,是不可能全部掌握的。 出于本人对linux ...