ATAC-seq
ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing） 是2013年由斯坦福大学William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室开发的用于研究染色质可及性 ...
原文：使用DiffBind 进行ATAC-seq peaks差异分析
DiffBind是基于peak的差异分析包，peaks由其他peak caller软件生成，如MACS HOMER.一个peak可能表示一个染色质开放区域 蛋白质结合位点等。call出来的peak是包含它的染色体 开始和结束位置信息的，然后可以通过bam文件根绝位置信息获取在peak上的read数量。进一步通过DESeq 或edgeR进行核心的差异分析。 官方文档：http: bioconduct ...
2020-10-28 21:22 0 2056 推荐指数：
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