系统发育树处理
PAUP PAUP（简约法和其他方法的亲缘分析）是由简约法、最大似然法和距离法用于亲缘分析的程序，为系统发育分析提供一个简单的，带有菜单界面的，与平台无关的，拥有多种功能（包括进化树图）的程序。 WINIPAUP 1.0 ...
原文：系统发育（进化）树绘制小结
目录 .分析软件 .进化树美化和注释 . iTOL美化 . ggtree .分析软件 很多很多软件，最常用的有： MEGA PHYLIP 构建进化树一般的步骤是：序列比对，构树 距离法，独立元素法 ，Booststrap验证。 通常如果是fasta序列，选用方法和软件直接构建就好。 如果要从vcf或hapmap等格式文件构建，则需要做一些处理。可以用类似SNPhylo的流程来处理，它支持VCF， ...
2020-10-26 19:57 0 2325 推荐指数：
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