1.什么是Reads? 高通量测序平台产生的序列就称为reads。 2.什么是Contig? 拼接软件基于reads之间的overlap区,拼接获得的序列称为Contig(重叠群)。 3.什么是Scaffold? 基因组de novo测序,通过reads拼接 ...
高通量测序数据分析: 高通量测序中,reads contigs scaffold unigene singleton各是什么,有什么关系 . 什么是read 高通量测序时,在芯片上的每个反应,会读出一条序列,是比较短的,叫read,它们是读序 就是我们测序产生的短读序列,通常一代和三代的reads读长在几千到几万bp之间,二代的相对较短,平均是几十到几百bp。PE reads 就是 paired ...
2020-10-10 21:24 0 2768 推荐指数:
1.什么是Reads? 高通量测序平台产生的序列就称为reads。 2.什么是Contig? 拼接软件基于reads之间的overlap区,拼接获得的序列称为Contig(重叠群)。 3.什么是Scaffold? 基因组de novo测序,通过reads拼接 ...
测序总结,高通量测序名词 主要来自 :http://mp.weixin.qq.com/s/iTnsYajtHsbieGILGpUYgQ 测序的黄金标准:一代测序了,故称之为黄金测序。 高通量测序最近这几年很火越来越火,但是世界上更多的还是一帮天天做分子克隆 ...
NGS基础 - 高通量测序原理 原创: 赑屃 生信宝典 2017-07-23 NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析、ChIP-seq分析、DNA甲基化分析、重测序分析五部分内容。 NGS基础系列文章包括高通量测序原理,测序数据获取和质量评估,常见文件格式解释和转换 ...
可以发现几个规律: 14年之前的公司主营业务都是科技服务 14年之后成立的公司几乎没有奔着科技服务去的,行业开始分化,主要是做基因检测、个人基因组、液体活检; ...
本篇文章,主要参考了阳光1986的博文(http://www.dxy.cn/bbs/topic/31324367),自己测序的分析结果作为对比,加在其中了。 1.简介 当二代测序的原始数据拿到手之后,第一步要做的就是看一看原始reads的质量。常用的工具就是fastqc (http ...
1.什么是Reads? 高通量测序平台产生的序列就称为reads。 2.什么是Contig? 拼接软件基于reads之间的overlap区,拼接获得的序列称为Contig(重叠群)。 3.什么是Scaffold? 基因组de novo测序,通过reads拼接获得Contigs后,往往 ...
快过年放假了,也终于闲下来了。每天游览于各种技术文章中,这种状态好极了。下午看篇关于js的文章,其中有如下这么一段引起了我的注意。 if (!~names.indexOf(name)) 中的操作符"!~" 什么意思,不理解,先从~入手。 测试可以得出结果值有这个的规律 -(X+1 ...