原文:高通量测序中的reads、contig、scaffold什么意思?

高通量测序数据分析: 高通量测序中,reads contigs scaffold unigene singleton各是什么,有什么关系 . 什么是read 高通量测序时,在芯片上的每个反应,会读出一条序列,是比较短的,叫read,它们是读序 就是我们测序产生的短读序列,通常一代和三代的reads读长在几千到几万bp之间,二代的相对较短,平均是几十到几百bp。PE reads 就是 paired ...

2020-10-10 21:24 0 2768 推荐指数:

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高通量测序,read、contigScaffold分别是什么

1.什么是Reads? 高通量测序平台产生的序列就称为reads。 2.什么是Contig? 拼接软件基于reads之间的overlap区,拼接获得的序列称为Contig(重叠群)。 3.什么是Scaffold? 基因组de novo测序,通过reads拼接 ...

Sat Feb 20 18:23:00 CST 2021 0 277
测序总结,高通量测序名词

测序总结,高通量测序名词 主要来自 :http://mp.weixin.qq.com/s/iTnsYajtHsbieGILGpUYgQ 测序的黄金标准:一代测序了,故称之为黄金测序高通量测序最近这几年很火越来越火,但是世界上更多的还是一帮天天做分子克隆 ...

Tue Oct 16 05:32:00 CST 2018 0 1199
NGS基础 - 高通量测序原理

NGS基础 - 高通量测序原理 原创: 赑屃 生信宝典 2017-07-23 NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析、ChIP-seq分析、DNA甲基化分析、重测序分析五部分内容。 NGS基础系列文章包括高通量测序原理,测序数据获取和质量评估,常见文件格式解释和转换 ...

Sat Oct 20 02:28:00 CST 2018 0 2435
国内高通量基因测序公司成立 时间表

可以发现几个规律: 14年之前的公司主营业务都是科技服务 14年之后成立的公司几乎没有奔着科技服务去的,行业开始分化,主要是做基因检测、个人基因组、液体活检; ...

Sat Jan 19 23:31:00 CST 2019 0 733
用FastQC检查高通量测序原始数据的质量

本篇文章,主要参考了阳光1986的博文(http://www.dxy.cn/bbs/topic/31324367),自己测序的分析结果作为对比,加在其中了。 1.简介 当二代测序的原始数据拿到手之后,第一步要做的就是看一看原始reads的质量。常用的工具就是fastqc (http ...

Sun Dec 27 04:09:00 CST 2015 0 6985
read、contigScaffold分别是什么

1.什么是Reads? 高通量测序平台产生的序列就称为reads。 2.什么是Contig? 拼接软件基于reads之间的overlap区,拼接获得的序列称为Contig(重叠群)。 3.什么是Scaffold? 基因组de novo测序,通过reads拼接获得Contigs后,往往 ...

Fri Sep 06 18:36:00 CST 2019 0 336
javascript !~ 什么意思

快过年放假了,也终于闲下来了。每天游览于各种技术文章,这种状态好极了。下午看篇关于js的文章,其中有如下这么一段引起了我的注意。 if (!~names.indexOf(name)) 的操作符"!~" 什么意思,不理解,先从~入手。 测试可以得出结果值有这个的规律 -(X+1 ...

Tue Feb 10 01:42:00 CST 2015 3 17428
 
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