原文:plink格式数据依据染色体拆分数据、依据染色体合并数据

准备测试数据 依据染色体拆分数据 root linuxprobe test wc l .map chr .map chr .map chr .map chr .map chr .map chr .map chr .map chr .map chr .map chr .map chr .map chr .map chr .map chr .map chr .map chr .map chr .ma ...

2020-10-05 16:49 0 1482 推荐指数:

查看详情

基因染色体定位

1.基因染色体定位TBtools Graphics-show gene on chr-第一个 文件准备: ①染色体长度信息 ②基因位置信息 #①:染色体长度文件 用基因组序列提取每条染色体的长度信息,结果是NC_开头的基因组编号,不是染色体号 记录 ...

Fri Dec 10 18:58:00 CST 2021 0 4019
依据SNP染色体和位置信息批量转换rs编号

如果只有SNP的染色体和物理位置信息,该如何批量转换得到 rs ID? 思路非常简单,只需要下载 dbSNP 的参考文件,根据位置信息从参考文件中获取对应的 rs 编号即可。 下面列举两个例子。 重命名 PLINK 文件 SNP 名字 第一个例子是 PLINK 格式的文件,要把 ...

Tue Sep 14 19:42:00 CST 2021 0 208
细胞,染色体,DNA与基因的关系

资料来源: 细胞、染色体、DNA和基因的关系 细胞核中包含染色体,人体共有23对染色体(22+XY/XX),染色体由DNA组成,DNA是由互补碱基对组成的双螺旋结构,DNA链中只有一部分信息可以编码为蛋白质,这些蛋白质是构成细胞和组织最小的组成成分,这些有效编码的部分称为gene,而不能有效编码 ...

Wed Jun 24 23:40:00 CST 2020 0 2646
对性染色体进行关联分析

欢迎来到"bio生物信息"的世界 1 前言 早期的研究普遍只做常染色体的全基因组关联分析,很少做性染色体的。 主要原因是性染色体的遗传模式比较复杂,存在X染色体失活,而且男女效应值不大一样。 其次,也不是所有的表型都是男女有差异的。 再然后,也没有很好的工具计算性染色体的关联分析 ...

Tue Nov 19 04:26:00 CST 2019 0 297
3D-DNA 挂载染色体

3D-DNA是一款简单,方便的处理Hi-C软件,可将contig提升到染色体水平。其githup网址:https://github.com/theaidenlab/3d-dna 3D-DNA流程简介 将Hi-C数据比对到draft.genome.fa。(利用Juicer分析Hi-C ...

Fri Apr 24 03:37:00 CST 2020 0 2677
如何快速将参考基因组拆分为各条染色体序列?

目录 需求 方法一 方法二 需求 客户反映,完整的基因组太大打不开,要我将之按各条染色体和scaffold拆分。如何快速实现? 方法一 借助工具: 方法二 自己写脚本:split.pl 运行:perl split.pl ...

Thu Apr 29 01:05:00 CST 2021 0 314
染色体共线性可视化

准备格式 可视化 LINKVIEW可视化 三个基因组染色体之间的共 ...

Tue Aug 17 19:40:00 CST 2021 0 197
 
粤ICP备18138465号  © 2018-2025 CODEPRJ.COM