原文:【数据库】本地NR数据库如何按物种拆分?

目录 .准备本地数据库文件 . NR库下载 . Taxonomy数据库下载 .按物种拆分NR库 . 第一步:获得Aceesson和分类物种的对应关系 . 第二步:获得分类物种的序列 . 第三步:建库和比对 .准备本地数据库文件 NR Non Redundant Protein Sequence Database 非冗余蛋白库,是所有GenBank EMBL DDBJ PDB中的非冗余蛋白序列。T ...

2020-09-26 20:27 0 1112 推荐指数:

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NR 数据库简介

目前有很多的数据库都存储了蛋白序列,比如NCBI Refseq, protein, swissprot 等,在各个数据库之间,或者是在某个数据库中,蛋白序列有大量冗余;为了方便使用,ncbi 构建了nr , 全称是 RefSeq non-redundant proteins ...

Sat Dec 23 00:27:00 CST 2017 4 13328
数据库的水平拆分

数据库的水平拆分 比如说订单,你第一要考虑业务场景,查询订单是哪些用户:其一是前端的用户;其二是后端的用户商家和客服。第二,它的存储量,订单的数据量是非常大的。但对商品和库存来说,它是有一定的范围的,不会无限的大,因为一个网站或者一个商店,你卖的SKU数量是 有限的。一个大超市可能是几万个SKU ...

Wed Mar 23 23:00:00 CST 2016 0 1707
数据库表的拆分

将存放在同一个数据库中的数据分散存放到多个数据库上,实现分布存储,通过路由规则路由访问特定的数据库这样一来每次访问面对的就不是单台服务器了,而是N台服务器,这样就可以降低单台机器的负载压力。sqlserver 2005版本之后,可以友好的支持“表分区”。   垂直(纵向)拆分:是指 ...

Thu Apr 16 22:33:00 CST 2020 0 672
数据库拆分案例

杭州湖畔网络技术有限公司是一家专业提供SaaS化电商ERP服务的创业公司,主要用户群体为经营淘宝、天猫、京东等主流电商平台、自建商城、线下渠道的商家及中小企业。作为SaaS服务提供商,服务数万乃至数十万级用户是业务架构初期就必须考虑的问题。庞大的用户群以及海量的用户数据意味着基础设施的构建必须兼顾 ...

Tue Feb 21 04:22:00 CST 2017 0 2597
数据库垂直拆分 水平拆分

当我们使用读写分离、缓存后,数据库的压力还是很大的时候,这就需要使用到数据库拆分了。 数据库拆分简单来说,就是指通过某种特定的条件,按照某个维度,将我们存放在同一个数据库中的数据 ...

Tue Mar 05 05:38:00 CST 2019 0 738
数据库水平拆分和是垂直拆分

当我们使用读写分离、缓存后,数据库的压力还是很大的时候,这就需要使用到数据库拆分了。 数据库拆分简单来说,就是指通过某种特定的条件,按照某个维度,将我们存放在同一个数据库中的数据分散存放到多个数据库(主机)上面以达到分散单(主机)负载 ...

Wed Sep 25 18:53:00 CST 2019 0 702
数据库的水平拆分和垂直拆分

随着业务的发展,数据库成为了整个系统性能的一个瓶颈,这时候就需要对数据库进行优化,但是单单是优化只能提高有限的一点性能,这时候要想解决问题需要的是从数据库架构层面去思考问题。数据库的架构是一个很大的课题,里面最实用的有两个,一个是数据库拆分,一个是读写分离。今天就来谈谈数据库的两种拆分方式 ...

Tue Jun 06 22:06:00 CST 2017 0 2143
数据库本地KEGG数据库如何拆分

目录 KEGG本地文件 按物种拆分KEGG数据库 1.获得物种分类信息 2.获得物种分类的序列信息并建 3.获得物种分类的K-ko对应文件 根据相似性原理,序列相似,功能相似,所有功能注释无非是用比对工具将输入序列比对 ...

Sat Sep 26 06:55:00 CST 2020 0 506
 
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