原文:samtools 安装使用

官网: https: github.com samtools samtools https: github.com samtools samtools releases https: github.com samtools samtools blob develop INSTALL 安装: wget https: github.com samtools samtools releases down ...

2020-08-29 21:10 0 1779 推荐指数:

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linux下bwa和samtools安装使用

bwa的安装流程安装本软体总共需要完成以下两个软体的安装工作:1) BWA2) Samtools1.BWA的安装a.下载BWA (download from BWA Source Forge ) http://bio-bwa.sourceforge.net/bwa.shtmlb.安装BWA ...

Fri Mar 06 03:06:00 CST 2015 0 12620
samtools使用

/Tutorial 安装 由于 samtools 与 htslib , bcftools 经常结合使用,因此, ...

Wed Sep 23 09:43:00 CST 2015 0 2096
samtools 使用简述

功能如下: 1、View   主要功能讲sam文件转位bam文件。 涉及的参数:   -b 输出bam格式。。默认是sam文件   -h 输出的sam文件带header。。默认不 ...

Fri Aug 03 05:59:00 CST 2018 0 2743
samtools和bcftools使用说明

转自:http://www.cnblogs.com/emanlee/p/4316581.html samtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集。包含有许多命令。以下是常用命令的介绍 1. view view命令的主要功能是:将sam文件转换成bam文件;然后对bam文件进行 ...

Tue May 16 02:31:00 CST 2017 0 5153
Samtools在Linux上非root权限的安装

第一次在Linux上不用root权限安装软件,查看了很多博客,并实践安装成功。大致总结了一下samtools安装过程,仅供大家参考,如有不对的地方,欢迎指正~ samtools安装过程中依赖于lzma、htslib两个包,所以在安装samtools之前需要确保安装了lzma、htslib ...

Fri Sep 08 02:51:00 CST 2017 19 3170
SAMTOOLS使用 SAM BAM文件处理

【怪毛匠子 整理】 samtools学习及使用范例,以及官方文档详解 #第一步:把sam文件转换成bam文件,我们得到map.bam文件 system"samtools view -bS map.sam > map.bam"; #第二步:sort 一下 BAM ...

Thu Dec 27 17:35:00 CST 2018 0 6697
SAM格式 及 比对工具之 samtools 使用方法

参考资料: SAMtools(官网) SAM Spec v1.4 (SAM格式 说明书) (重要) samtools-1.3.1 使用手册 (SAMtools软件说明书) samtools常用命令详解(博客园) SAM格式定义(博耘生物) samtools使用 ...

Tue Jun 21 21:47:00 CST 2016 0 6887
 
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