原文:【6】肿瘤胚系突变遗传分析及数据库使用

目录 遗传性肿瘤简介 检测和分析流程 如何生成一份报告 实例 遗传性肿瘤简介 遗传性肿瘤综合征:由于遗传性原因导致的染色体和基因异常,造成系统性肿瘤患病几率大大增加 germline variant:存在所有细胞中 somatic mutation:仅存在肿瘤细胞中 多数遗传性肿瘤为常染色体显性遗传 AD遗传 :父母的致病突变有 概率遗传给后代,外显不全 携带不一定表现 ,遗传易感性 好患某种遗 ...

2020-08-28 09:28 0 1639 推荐指数:

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maftools|TCGA肿瘤突变数据的汇总,分析和可视化

本文首发于公众号“生信补给站”,https://mp.weixin.qq.com/s/WG4JHs9RSm5IEJiiGEzDkg 之前介绍了使用maftools | 从头开始绘制发表级oncoplot(瀑布图) R-maftools包绘制组学突变结果(MAF ...

Tue Sep 17 07:19:00 CST 2019 3 2106
常用肿瘤相关数据库

目录 1. 综合性肿瘤数据库 TCGA ICGC COSMIC cBioPortal UCSC Cancer Genomics Browser canEvolve CGAP CGHub CGWB ...

Sun Aug 02 01:37:00 CST 2020 0 8309
【8】肿瘤临床遗传咨询及案例分析

目录 遗传咨询简介 肿瘤基因检测 遗传咨询简介 遗传疾病——专业知识——风险评估——沟通技巧——技术支持 咨询师工作流程 肿瘤基因检测 肿瘤发生的根本原因是基因突变 突变累积 一般发生到恶化要10年左右 样本 ...

Fri Aug 28 17:31:00 CST 2020 0 609
ComplexHeatmap 绘制肿瘤突变分布图

来源:https://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/ 安装 7.2 Apply to cBioPortal dataset 通过使用实际数据展示oncoPring()的优势。数据来源于cBioPortal。执行步骤 ...

Wed Sep 11 18:36:00 CST 2019 1 2164
肿瘤分析数据挖掘及信息解读

目录 肿瘤基础 肿瘤基因组基础 肿瘤高级分析模块 1. SNV和InDel 1. 1体细胞SNV和InDel 1)超突变样本分类 2)SMGs 3)突变特征 ...

Thu Jul 02 07:09:00 CST 2020 0 2092
oracle数据库查询全整理

oracle数据库方面的知识到今天已经整理了12篇。当然,这不是终点,这只是一个开始,希望我写的文章可以帮助更多初学数据库的童鞋快速上手,如果你觉得文章对你有帮助,那么恭喜你已经入门了,数据库里面的知识有很多,多到让你可以从入门到放弃。那么你可以通过该篇文章快速入门oracle中关于查询 ...

Wed Feb 07 00:23:00 CST 2018 2 834
Oracle数据库awr报告使用分析

转:https://www.cnblogs.com/zhaot1993/p/13530739.html 一 AWR报告生成 1、生成AWR(Automatic Workload Repositor ...

Wed Mar 16 18:39:00 CST 2022 0 825
【3】肿瘤基因组数据分析方法概述

目录 肿瘤基因组分析 肿瘤标准分析 高级分析 肿瘤数据库 肿瘤基因组分析 肿瘤进化过程 基本概念:germline/somatic/driver/passenger mutation 二次打击学说:生殖突变+体细胞突变 主要 ...

Tue Aug 25 17:46:00 CST 2020 0 948
 
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