LDheatmap | SNP连锁不平衡图（LD）可视化，自己数据实现版！
本文首发于“生信补给站”，https://mp.weixin.qq.com/s/Gl6BChxSYbSHMo9oMpufPg 连锁不平衡图，用来可视化不同SNP之间的连锁程度，前同事间俗称“倒三角”图。 本文使用自己的数据，因为安装R包后使用内置数据集运行出结果较容易 ...
原文：推荐一个画连锁不平衡图（LD block）的软件LDBlockShow，亲测比haploview好用！
最近需要画LD block,之前一直用haploview软件画，haploview软件毛病比较多，比如不能有多态位点，输入的变异位点不能太多等。动不动就报错。 最近试了一下另外一个画LD block的软件LDBlockShow，比haploview好用许多。不需要自己剔除多态位点，直接输入vcf文件即可，简直就是心头好。 直接下载安装: 画LD图： LDBlockShow InVCF genome ...
2020-08-18 23:20 3 3177 推荐指数：
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