最近需要画LD block,之前一直用haploview软件画,haploview软件毛病比较多,比如不能有多态位点,输入的变异位点不能太多等。动不动就报错。 最近试了一下另外一个画LD block的软件LDBlockShow,比haploview好用许多。不需要自己剔除多态位点,直接输入vcf ...
最近,看到Front. Genet.发了一篇文章 IntAssoPlot: An R Package for Integrated Visualization of Genome Wide Association Study Results With Gene Structure and Linkage Disequilibrium Matrix ,主要推出了一个R包IntAssoPlot,该包整 ...
2020-08-12 20:05 5 1607 推荐指数:
最近需要画LD block,之前一直用haploview软件画,haploview软件毛病比较多,比如不能有多态位点,输入的变异位点不能太多等。动不动就报错。 最近试了一下另外一个画LD block的软件LDBlockShow,比haploview好用许多。不需要自己剔除多态位点,直接输入vcf ...
GWAS入门必看教程:Statistical analysis of genome-wide association (GWAS) data 名词解释和基本问题: 关联分析:就是AS的中文,全称是GWAS。应用基因组中数以百万计的单核苷酸多态;SNP为分子遗传标记,进行全基因组水平 ...
本文首发于“生信补给站”,https://mp.weixin.qq.com/s/Gl6BChxSYbSHMo9oMpufPg 连锁不平衡图,用来可视化不同SNP之间的连锁程度,前同事间俗称“倒三角”图。 本文使用自己的数据,因为安装R包后使用内置数据集运行出结果较容易 ...
[注] 本文不是包图的基础教程, 只是包图的图形总结. 学习UML图形 推荐阅读<UML参考手册>第2版. http://www.umlchina.com/ 推荐微软的开发软件设计模型 http://msdn.microsoft.com/zh-cn/library ...
哈代-温伯格平衡定律(Hardy-Weinberg equilibrium),即HW平衡,是指对于一个大且随机交配的种群,基因频率和基因型频率在没有迁移、突变和选择的条件下会保持不变。它是建立在一个理想的群体模式上的,有四个假设前提:1.群体无限大;2.随机婚配;3.没有突变;4.没有大规模迁移 ...
。 安装 稳定版 npm install --save redux 附加包 React 绑定 ...
前言 最近一段时间,越来越多的小伙伴开始学习上位机,学上位机必须要配套PLC硬件,如果不想购买,又想学习,只能用软件搭建仿真环境了。但是很不幸的是,由于系统原因或者其他未知原因,经常会遇到各种各样的问题,因此本文主要针对博图V16安装、PLCSIM-Advanced安装及授权进行详细 ...
SQL索引一步到位(此文章为“数据库性能优化二:数据库表优化”附属文章之一) SQL索引在数据库优化中占有一个非常大的比例, 一个好的索引的设计,可以让你的效率提高几十甚至几百倍,在这里将带你一步步揭开他的神秘面纱。 1.1 什么是索引? SQL索引 ...