原文:Meta-analysis of GWAS | 原理 | 实例

TOC Meta analysis是什么 常用的工具有哪些 深入Meta analysis的统计学原理 Meta analysis实例,输入输出分别是什么 Meta analysis注意事项,模型选择 关于Meta的在不同场景下的意思 Meta analysis是什么 常用的工具有哪些 就是整合分析,大概是借鉴了医学里的meta分析,将不同的GWAS整合到一起,可以是同一个trait,也可以是几个 ...

2020-07-24 02:28 0 1165 推荐指数:

查看详情

GWAMA:gwas meta-analysis工具

下载和安装 从官网(https://genomics.ut.ee/en/tools/gwama-download)上下载或: wget http:/www.geenivaramu.ee ...

Wed Nov 04 05:04:00 CST 2020 0 377
GWAS条件分析(conditional analysis

一、为什么要做GWAS的条件分析(conditional analysis) 我们做GWAS的时候,经常扫出一堆显著的信号,假设rs121是我们扫出来与某表型最显著相关的位点(P=1.351e-36),rs124尾随其后(6.673e-22),也是与该表型显著相关,那么这个时候,我们就有问题 ...

Thu Jan 17 03:20:00 CST 2019 0 1302
一行命令学会全基因组关联分析(GWAS)的meta分析

为什么需要做meta分析 群体分层是GWAS研究中一个比较常见的假阳性来源. 也就是说,如果数据存在群体分层,却不加以控制,那么很容易得到一堆假阳性位点。 当群体出现分层时,常规手段就是将分层的群体独立分析,最后再做meta分析。 1.如何判断群体是否分层 先用plink计算PCA ...

Fri May 24 00:09:00 CST 2019 0 1472
全基因组关联分析(GWAS)的计算原理

前言 关于全基因组关联分析(GWAS原理的资料,网上有很多。 这也是我写了这么多GWAS的软件教程,却从来没有写过GWAS计算原理的原因。 恰巧之前微博上某位小可爱提问能否写一下GWAS的计算原理。我一顺口就答应了。 后面一直很懒,不愿意动笔,但想着既然答应了,不写说不过去。 我写 ...

Wed Oct 23 02:49:00 CST 2019 0 1269
Latent Semantic Analysis(LSA/ LSI)原理简介

LSA的工作原理: How Latent Semantic Analysis Works LSA被广泛用于文献检索,文本分类,垃圾邮件过滤,语言识别,模式检索以及文章评估自动化等场景。 LSA其中一个目的是解决如通过搜索词/关键词(search words)定位出相关文章。如何通过对比单词 ...

Tue Sep 04 01:46:00 CST 2018 0 1352
 
粤ICP备18138465号  © 2018-2025 CODEPRJ.COM