原文:使用Aspera (ascp 命令)从NCBI高速下载数据

. 简介 生物信息研究人员往往需要从NCBI sra 或者EBI ENA下载高通量的测序数据。而通过NCBI申请获得的数据往往需要通过Aspeara进行下载。 . Aspeara 安装 wget http: d gcli yxqn z.cloudfront.net connect bin aspera connect . . . linux .tar.gz tar zxf aspera conn ...

2020-07-23 17:40 0 2770 推荐指数:

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github高速下载的方法

windows修改host文件: C:\Windows\System32\drivers\etc\hostslinux 修改host文件: /etc/hosts 在文件后面加上这两行 ...

Fri Feb 01 00:45:00 CST 2019 0 1299
国内高速下载Docker

一般情况下,我们可以从Docker官网下载docker安装文件,但是官方网站由于众所周知的原因,不是访问慢,就是下载慢。下载docker安装包动不动就要个把小时,真是极大的影响工作效率。 在这里推荐一个docker的下载(主要是Windows版)地址: https://oomake.com ...

Fri Mar 29 22:28:00 CST 2019 0 3141
使用sratoolkit下载NCBI数据

如何使用sratoolkit下载NCBI数据? 比如我想下载这个研究的数据使用prefetch命令,输入对应的SRA号码 prefetch SRR10861695 默认下载限制是20G的数据,如果下载数据较大,可以修改配置,比如改为最大100G prefetch --max-size ...

Thu Apr 09 21:56:00 CST 2020 0 1420
使用aspera从EBI下载fastq数据

前面我们大量NGS相关教程视频免费发布在B站,都是使用NCBI的SRA数据下载sra文件后转为fastq进行NGS分析流程,其实是因为我本人一直不在中国大陆,所以没有网络问题。但是学生们不一样,同样的命令他们prefetch的下载比蜗牛还慢,即使加上aspera后也会面临sra文件转为 ...

Thu Jul 30 18:42:00 CST 2020 0 1124
Linux实现多线程高速下载

使用Wget下载,有时候速度挺慢的。 有没有好办法呢? 一、解决方案 安装axel 安装方法: 二、其它安装 也可以安装yum-axelget插件,默认 yum使用单线程下载,安装该插件后,会使用多线程下载。 ...

Thu Aug 03 18:41:00 CST 2017 0 4063
OneDrive高速下载链接分享

目录 1. 按 2. 资源链接 3. 打赏&支持&联系我 1. 按 建议不了解的先看下:OneDrive下载教程,以防出现莫名其妙的问题:如下载的文件打不开,无法正常访问资源链接。 另外使用 ...

Mon Jul 22 06:41:00 CST 2019 10 58210
 
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