自从2009年单细胞转录组测序(single-cell RNA-seq,scRNA-seq)技术首次问世,至今已经有几十种不同的scRNA-seq技术相继被开发出来。在过去的十年里,单细胞转录组测序技术得到了蓬勃的发展,从而使得可在单细胞水平揭示全基因组范围内所有基因的表达情况,可以更精准的开展 ...
转录组紧紧围绕基因表达量和功能分析两部分,结合生物学问题来进行数据分析。 高表达基因已经研究比较透彻,应该更多关注中低表达基因。 层次聚类的妙用: 全部基因 gt 差异分析 gt 根据趋势挑选部分特异性基因 gt 功能分析 功能大类聚类 gt 根据趋势挑选部分特异性功能 gt 功能小类聚类 通路表达量的计算:该通路全部基因表达量之和除以该通路基因数 趋势分析 cmeans聚类 阐释不了太多生物学问 ...
2020-07-19 11:45 0 2013 推荐指数:
自从2009年单细胞转录组测序(single-cell RNA-seq,scRNA-seq)技术首次问世,至今已经有几十种不同的scRNA-seq技术相继被开发出来。在过去的十年里,单细胞转录组测序技术得到了蓬勃的发展,从而使得可在单细胞水平揭示全基因组范围内所有基因的表达情况,可以更精准的开展 ...
当前,关于高通量蛋白质组学的研究远不如NGS这般火热,网上关于这方面的知识也寥寥无几,从事这一行也有一段时间了,但还没好好总结过。加之过段时间可能要去做培训,所以是时候把知识点总结一下,权当复习。当然整个蛋白质组学研究也算纷繁复杂,不可能面面俱到,而且很多东西我也在学习当中,肯定会出现不少纰漏 ...
目录 非靶向代谢组实验设计 数据分析流程 1.数据预处理 2.数据质控 3.统计分析 非靶向代谢组实验设计 1.代谢物提取,一般要求每组至少10个样; 2.在所有提取好的样本中取等量混合作为QC; 3.QC样本与实验 ...
,可多种几款流程比较。 实际上SV结果中会包含CNV,但往往会把CNV单独拿出来分析。 ...
非靶向代谢组实验设计 1.代谢物提取,一般要求每组至少10个样; 2.在所有提取好的样本中取等量混合作为QC; 3.QC样本与实验样本穿插上机,开始十个QC,结尾三个QC,中间每十个样本穿插一个QC样本 。 得到质谱谱图数据经软件处理后得到峰表。 峰表格式一般为:每行为一个m/z,每列为一个样 ...
目录 肿瘤基因组分析 肿瘤标准分析 高级分析 肿瘤数据库 肿瘤基因组分析 肿瘤进化过程 基本概念:germline/somatic/driver/passenger mutation 二次打击学说:生殖突变+体细胞突变 主要 ...
数据分析的概念 什么是数据分析 就是从现有的数据中挖掘出价值 数据分析应用领域 商品推荐 eg:在淘宝上搜索了一款产品之后,接下来就会疯狂给你推荐相关产品 量化交易 股票,期货等数据分析 短视频推送 抖音,今日头条等短视频 (数据分析 ...