post-GWAS：使用coloc进行共定位分析(Colocalization)
GWAS找到显著信号位点后，需要解释显著信号位点如何影响表型。 常见的一个解释方法是共定位分析。 主流的共定位分析包括： 1）GWAS和eQTL共定位； 2）GWAS和sQTL共定位； 3）GWAS和meQTL共定位； 4）GWAS和pQTL共定位； 其中，GWAS ...
原文：FINEMAP：使用GWAS摘要数据进行无功能注释数据的精细定位（Fine-mapping）
介绍 全基因组关联分析 GWAS 是非常流行的定位表型或疾病遗传位点方法。不过很多情况下，GWAS 发现的最显著的 SNP top SNP 或者 index SNP 并不是真正造成影响的causal SNP 因果SNP ，而是因为跟 causal SNP 之间存在的 LD 而变得显著。因而，后续还需要对结果进行 fine mapping 精细定位 ，把 causal SNP找到。 如果想了解更多 ...
2020-07-09 09:51 0 1756 推荐指数：
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