我的原始测序数据是双端测序，在用trim_galore软件去接头的这一步，使用的命令行是 相当然的以为软件会默认为双端测序，结果接下来一步用tophat软件mapping到参考基因组上的时候，发现mapping率只用10%，低的惊人。后来排除建库失败的可能，我去查看 ...

Trimmomatic 注意：软件工具一般会定期进行迭代更新，如果使用出现问题，请查看官方文档。 可以用来切除illumina测序平台的接头序列，还可以去除由我们自己指定的特定接头序列，而且同时也能够过滤read末尾的低质量序列。具体的原理就是通过滑动一定长度的窗口，计算 ...

fastp 注意：软件工具一般会定期进行迭代更新，如果使用出现问题，请查看官方文档。 fastp是一款数据质控过滤软件，作者是陈实富，来自深圳海普洛斯公司。他们将这款工具开源免费使用，这一点是非常值得称赞的。其实国内很多测序公司都有自己开发的数据处理程序，不过很多都在内部使用 ...

Trim Galore是对FastQC和cutadapt的包装。适用于所有高通量测序，包括RRBS(Reduced Representation Bisulfite-Seq )、 Illumina、Nextera和smallRNA测序平台的双端和单端数据。主要功能包括两步：第一步首先去除低质量碱基 ...

ipmi 檢視 What links here 週二, 07/31/2007 - 10:12 — sunchiahome ...

Trim Galore是一个非常流行的用于「去接头序列」的软件，用于处理高通量测序得到的原始数据。通常我们从测序公司拿到数据后，第一步就是评估数据的质量以及对raw data去接头处理。公司拿来的数据通常附带了clean data以及去接头的说明文件，我自己重新实现了一下trim的过程。参数都是 ...

前言 关于蛋白质组学，你是不是已经听了太多公司的宣讲，介绍了一大堆的技术名词，反而越听越懵懂，脑袋一团乱麻？就和传话游戏一样，当我们接收了多手信息以后，得到的信息就越不准确。那么，何不自己看一看第一 ...

Ipinstall软件工具操作说明 安居宝Ipinstall软件工具是用于联网型对讲系统中网络设备的属性及参数修改，该设备在系统中是否能正常运行，其属性和参数的设置起着决定性的作用， 然而设备的属性、参数设置是否能成功地设置好，则关系着Ipinstall软件工具的正确操作与否。 文件 ...