基因表达式编程(Gene Expression Programming,GEP)是由葡萄牙科学家Candida Ferreira 2001年提出来的一种新型遗传算法,其特点是将基因型和表现型分离。GEP 继承了GA的快速、易用和GP的易变、多能,比GA,GP提高速度100 - 1000000倍 ...
做RNA seq的数据分析,一直弄不清楚实验过程,最近有时间就找一些资料来了解一下,同时将整理的资料记录下来,方便以后查找。 来源资料: D演示 基因的表达 原版 字幕版 人体从食物中获取营养的过程也就是化学消化过程,是通过酶对食物进行分解来得到营养物质。DNA用来制造酶和各种蛋白质。DNA包含基因,基因是一段连续的核苷酸序列,这个序列包含一个区域编码供RNA分子进行转录。 编码区域从启动子开始, ...
2020-06-23 16:11 0 1411 推荐指数:
基因表达式编程(Gene Expression Programming,GEP)是由葡萄牙科学家Candida Ferreira 2001年提出来的一种新型遗传算法,其特点是将基因型和表现型分离。GEP 继承了GA的快速、易用和GP的易变、多能,比GA,GP提高速度100 - 1000000倍 ...
做了好久的RNA-seq分析,基因表达也在口头溜了几年了,但似乎老是浮在表面。 对一件事的了解程度决定了你的思维深度,只想做技工就不用想太多,想做大师就一定要刨根问底。 老是说基因表达,那么什么是基因表达?我们测序得到的基因表达其实只是一种表型,是样本的一个快照,和普通的身高体重之类的连续型 ...
做单细胞RNA-seq分析,自然就能想到我们测到的其实是一个概率学的东西,就像女士品茶里的酵母的泊松分布一样。 真实的细胞里,一切都是连续的,从DNA到mRNA到蛋白,是有一个时间间隔的,每一个pr ...
#http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2881355/ 一致聚类方法,采用重抽样方法来验证聚类合理性。 library(ALL)data(ALL)d=exprs(ALL)d[1:5,1:5] #对上面这个芯片表达数据我们一般会简单的进行 ...
接前一篇: 用R和BioConductor进行基因芯片数据分析(五):芯片间归一化 经过一系列的预处理,包括缺失值填充,中位数计算以及归一化,我们的数据终于可以用啦。 下面我们就来分析一下new population和old population的个体是否有差异表达基因。 判断一个基因是否 ...
这篇文章更多的是对于混乱的中文资源的梳理,并补充了一些没有提到的重要参数,希望大家不会踩坑。 1. 简介 1.1 背景 WGCNA(weighted gene co-expression network analysis,权重基因共表达网络分析)是一种分析多个样本 ...
利用建立分级树对酵母基因表达数据进行聚类分析 一、原理 根据基因表达数据,得出距离矩阵 ↓ 最初,每个点都是一个集合 每次选取距离最小的两个集合,将他们合并,然后更新这个新集合与其它点的距离 新集合与别的集合距离的计算方法 ①两个集合之间的最短 ...
image Gene Set Enrichm ...