生信文件格式-SAM文件
SAM文件格式 SAM（The Sequence Alignment / Map format）格式，即序列比对文件的格式，详细介绍文档 以下内容参考2019年1月SAM文件说明文档，具体细节请关注最新文档说明 SAM文件由两部分组成：头部信息和比对信息，都是以tab键分隔 ...
原文：生信文件格式-BED文件
BED文件格式 注释文件就是基因组的说明书。告诉我们哪些序列是编码蛋白的基因，哪些是非编码基因，外显子 内含子 UTR等的位置等等。注释文件在以下三个提供参考基因组的网站中都有提供，比如Ensemble NCBI UCSC。但是现在最权威的人类和小鼠基因组的注释还属Gencode数据库。 基因组注释 genomic features 通常使用Browser Extensible Data BED ...
2020-06-22 15:56 0 580 推荐指数：
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bed文件（browse extensive data）以及gff文件（general fearture format） bed文件 第一列是染色体或者contig信息。 第二列是起始位置，从0开始。 第三列是终止位置。 第四列是bed列的名字。 第五列是score。 第六列是链方向 ...
bed文件格式解读
1）BED文件 BED 文件(Browser Extensible Data)格式是ucsc 的genome browser的一个格式 ,提供了一种灵活的方式来定义的数据行，以用来描述注释信息。BED行有3个必须的列和9个额外可选的列。每行的数据格式要求一致(见下图)。 每条线的字段 ...
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