原文:ComplexHeatmap|根据excel表绘制突变景观图(oncoplot)

本文首发于 生信补给站 :https: mp.weixin.qq.com s kz oKvUQrCR HWYXQT g 如果有maf格式的文件,可以直接oncoplot包绘制瀑布图,有多种展示和统计maftools 从头开始绘制发表级oncoplot 瀑布图 和maftools TCGA肿瘤突变数据的汇总,分析和可视化,如果只有多个样本的基因突变与否的excel,不用担心,也可以用complex ...

2020-06-17 18:51 0 896 推荐指数:

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ComplexHeatmap 绘制肿瘤突变分布

来源:https://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/ 安装 7.2 Apply to cBioPortal dataset 通过使用实际数据展示oncoPring()的优势。数据来源于cBioPortal。执行步骤 ...

Wed Sep 11 18:36:00 CST 2019 1 2164
使用GenVisR包进行驱动突变的热绘制

使用GenVisR包进行驱动突变的热绘制 介绍 通过热显示突变的整体情况 代码讲解 加载包,读入数据 它的输入数据’drivers_lung.txt’部分如下 代码如下 这里用GenVisR包的waterfall函数进行突变的瀑布绘制 ...

Fri Nov 13 06:44:00 CST 2020 0 446
complexHeatmap包画分类热

用途:一般我们画热是以连续变量作为填充因子,complexHeatmap的oncopoint函数可以以类别变量作为填充因子作热。 用法:oncoPrint(mat, get_type = function(x) x,alter_fun = alter_fun_list ...

Wed Nov 08 23:10:00 CST 2017 0 2473
Excel绘制Q-Q

Q-Q可以用于检验样本是否服从正态分布,在Excel绘制Q-Q步骤如下(参考How do you make Q-Q plot in Excel?): 排序的数据集 A sorted data set 对数据点排序的序数序列 An ordinal sequence to rank ...

Fri May 29 06:48:00 CST 2020 0 2583
Python Excel 绘制柱形

本文主要讲述如何使用Python操作Excel绘制柱形。 相关代码请参考 https://github.com/RustFisher/python-playground 本文链接:https://www.rustfisher.com/2019/11/19/Python ...

Wed Nov 20 06:07:00 CST 2019 0 2185
Python openpyxl Excel绘制柱形

这是一份openpyxl的使用指南。 大体内容翻译自官网 https://openpyxl.readthedocs.io/en/stable/charts/bar.html#vertical-hor ...

Fri Nov 15 06:08:00 CST 2019 0 1120
3D园林景观效果制作步骤

城市打造园林景观能够给市民带来更加优美的环境,也能在烦躁的城市里有一处可以休息的宁静之地,让人们感到更加幸福。园林景观要制作好,可能需要尽管多番的讨论,在设计阶段就需要先做一个效果出来让大家能看到做出来的园林景观直接效果,进而参与讨论。现在园林景观大多是用3d的方式呈现,那么3D ...

Wed Feb 15 19:34:00 CST 2017 0 2247
 
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