原文:【R方差分析】蛋白质表达量多组比较

初始数据类似: 蛋白质组数据虽不是严格的正态分布,但目前最常用的检验方法还是T检验 两组比较 和方差分析 多组比较 。这个话题值得深究,这里不展开。 主要是求多个蛋白的Pvalue值或FDR,用于差异筛选。 ...

2020-06-16 17:09 0 718 推荐指数:

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蛋白质组学实验设计、质控与分析

1. 实验设计与技术路线 (1) 常用流程 流程 说明 1.材料收集 细胞、细胞上清、组织、血浆、血清、脑脊液、外泌体、尿液...... 2.定量技术 蛋白组:iTRAQ/TMT ...

Thu Jan 16 05:19:00 CST 2020 0 2942
R语言构建蛋白质网络并实现GN算法

R语言构建蛋白质网络并实现GN算法 目录 R语言构建蛋白质网络并实现GN算法 1.蛋白质网络的构建 2.生物网络的模块发现方法 3.模块发现方法实现和图形展示 1) 基于点连接的模块发现 ...

Mon Sep 23 06:35:00 CST 2019 0 1222
蛋白质组学数据分析——(1)原理

当前,关于高通量蛋白质组学的研究远不如NGS这般火热,网上关于这方面的知识也寥寥无几,从事这一行也有一段时间了,但还没好好总结过。加之过段时间可能要去做培训,所以是时候把知识点总结一下,权当复习。当然整个蛋白质组学研究也算纷繁复杂,不可能面面俱到,而且很多东西我也在学习当中,肯定会出现不少纰漏 ...

Thu Jul 18 06:59:00 CST 2019 1 9679
R语言-方差分析

方差分析指的是不同变量之间互相影响从而导致结果的变化 1.单因素方差分析:   案例:50名患者接受降低胆固醇治疗的药物,其中三种治疗条件使用药物相同(20mg一天一次,10mg一天两次,5mg一天四次),剩下的两种方式是(drugE和drugD),代表候选药物      哪种药物治疗降低 ...

Sun Feb 18 07:19:00 CST 2018 0 1536
R语言——方差分析

一、方差分析的基本概念 方差分析是在20世纪20年代发展起来的一种统计方法,它是由英国统计学家费希尔在进行实验设计时为解释实验数据而首先引入的。 从形式上看,方差分析比较多个总体的均值是否相等;但是其本质上是研究变量之间的相互关系。方差分析主要用于研究一个数值因变量与一个或多个分类自变量 ...

Mon May 22 23:58:00 CST 2017 0 1821
蛋白质结构模建初探

目录 相关链接 蛋白质模建的几种方法 同源模建 折叠识别 从头预测 综合方法 实地操作&预测结果 路线 预测结果 Swiss ...

Fri Apr 17 07:19:00 CST 2020 0 592
蛋白质基因组】Proteogenomics方法介绍及分析思路

概念 利用蛋白质组学数据,结合基因组数据(DNA)、转录组数据(RNA)来研究基因组注释问题,被称为蛋白质基因组学。“蛋白质基因组学”一词由Jaffe 等于2004 年首次提出,作者采用串联质谱数据匹配DNA翻译得到氨基酸序列的方法,在仅有810 kb 大小的细菌基因组上直接鉴定开放阅读框 ...

Tue Mar 10 06:49:00 CST 2020 0 1302
 
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