根据VCF构建进化树
VCF2Dis，是一款计算根据vcf文件计算距离矩阵的小工具 1 安装 下载后 2 示例文件进行简单使用 操作 得到的结果如下所示 3 构建树 在线构建 上传距离矩阵到在线网站, FastMe2.0。上传以后，选择Data type为Distance ...
原文：基于遗传距离的方法构建系统进化树
一 基于SNPs和INDELs估计遗传距离 Plink file distance matrix recode out Distance.out 生成两个文件： .Distance.out.mdist .Distance.out.mdist.id 二 接下来基于遗传距离矩阵构建系统进化树软件使用 lustre softs phylip neighbor 邻接法 ,输入mdist文件,生成outfi ...
2020-06-13 11:16 1 1881 推荐指数：
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--系统进化树-原理介绍及软件使用-- 引自：http://blog.sina.com.cn/s/blog_670445240101l3ai.html 什么叫系统进化？ 系统发生分析一般是建立在分子钟基础上的。分子钟:分子序列进化是按照一恒定速率进行的，所以积累突变的数量 ...
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