使用XP-CLR检测基因组中的选择信号
检测基因组选择信号的方法有很多种，其中 XP-CLR 方法是常用的一种。XP-CLR 是陈华老师、Nick Patterson 和 David Reich 在 2010 年发表的方法，全称叫 the cross-population composite likelihood ratio test ...
原文：使用Python版XP-CLR检测基因组中的选择信号
上一篇文章 使用XP CLR检测基因组中的选择信号 介绍了 XP CLR。XP CLR 是一种是基于选择扫荡 selective sweeep 的似然方法。选择扫荡可以增加群体之间的遗传分化，导致等位基因频率偏离中性条件下的预期值。XP CLR 利用了两个群体之间的多基因座等位基因频率差异 multilocus allele frequency differentiation 建立模型，使用布朗运 ...
2020-06-13 19:50 0 598 推荐指数：
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