原文:Linux 生信项目案例在线分析

本文转自https: freeaihub.com article bioinformatics in linux.html,该页可在线进行操作。 Linux对生物信息的学习和实践有强大的辅助作用,不管自己编写shell命令脚本处理数据,还是使用现有丰富生物信息分析工具。Linux强大命令行功能,可以快速 批量 灵活的处理数据的提取 统计和整理等耗时耗力的重复性工作。日常生信分析中,多数整理工作都是 ...

2020-06-09 09:18 0 728 推荐指数:

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常用分析软件

官网 源码 安装&使用 BWA http://bio-bwa.sourceforge.net/ ht ...

Sat Nov 03 06:05:00 CST 2018 0 906
部署一个简单的分析流程

在生公司里,有相当一部分人都是负责编写流程和维护流程。 流程pipeline,就是让用户(前端)在填写配置文件后能够一键运行的脚本,最终自动得出结果,并生成报告,有的公司还会将结果上传。 自动化pipeline必须具备的功能: 读取配置文件,生成相应的待执行的脚本 按照先后 ...

Tue Nov 29 00:03:00 CST 2016 0 3608
案例分析——快手百万在线直播

一、前言 首先分享出原文链接 http://www.infoq.com/cn/news/2017/09/streaming-Pipeline-kuaishou。自己平时并未用过 ...

Fri Sep 15 06:05:00 CST 2017 0 1560
实验四 软件项目案例分析

实验四 软件项目案例分析 2020-4-2 Deadline:2020-4-11 10:00,以博客发表日期为准 评分标准: 按时交 - 有分(满分100分),检查项目包括: 任务1部分(32分) 任务2部分(10分) 任务3部分(46分) 任务4部分(12分 ...

Thu Apr 02 06:10:00 CST 2020 0 2058
分析-windows-blast序列比对

这是一个尝试性的文章,能不能解决我要解决的问题,并不清楚。 ===本文利用NCBI的blast界面,实现将短序列比对上reference基因组,并实现变异位点可视化。===补言=== 比对常用的是 ...

Thu Dec 03 02:28:00 CST 2020 0 487
基础知识【04】GO和pathway分析

非原创 参考资料: 一文掌握GO和pathway分析 - 生物信息学讨论版 -丁香园论坛http://www.dxy.cn/bbs/thread/34904124#34904124 GO富集 GO是Gene ontology的缩写,GO数据库分别从功能、参与的生物途径及细胞 ...

Fri Jun 22 19:59:00 CST 2018 0 16287
 
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