DNA甲基化
一、DNA甲基化简介 1 、概念：DNA甲基化是一种重要的表观遗传，是指DNA被化学小分子修饰的一种方式，即甲基（-CH3）共价结合到脱氧核糖核苷酸上，可以不改变脱氧核糖核苷酸序列而引起基因表达的的改变。 2 、发生位点：真核生物常见的甲基化位点有CpG（最主要）、CHG（H指A/T/C ...
原文：甲基化数据QC：使用甲基化数据计算样本间的相关性
样本间的相关性，可以反映公司加样时是否存在重复加样的错误。 下面简要介绍一下如果利用甲基化数据计算样本间的相关性 提取甲基化探针的snp位点 CpG的beta值 下面用的示例文件是minfi包自带的。 如果是自己的数据，那么提取甲基化snp位点用的是没有经过过滤的原始数据。 首先，安装： 这里可以看到不同探针的情况： 一条龙服务，提取甲基化探针的snp位点 CpG的beta值： CpG和SNP的b ...
2020-05-26 19:27 2 572 推荐指数：
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