补充RNA-seq流程 以前都是自己搭RNA-seq流程,虽然可以完成任务,但是数据量一多,批次多起来,就非常难管理。 既然别人提供了这么好的流程,那就要用起来,管理起来不是一般的轻松。 ENCODE-DCC/rna-seq-pipeline 安装比较麻烦,没有针对local的一键安装 ...
本文的分析套路剑指 分的journal,全是干货。 发现一个不错的专题,讲得很详细。 ATAC seq ChIP seq分析方法 其中一个细节IDR,讲得很通俗。 第 篇:重复样本的处理 IDR ATAC seq data analysis: from FASTQ to peaks 基本概念: ATAC seq和ChIP seq鉴定出来的peak到底是一些什么区域 除了promotoer就是enh ...
2020-05-25 00:14 0 4253 推荐指数:
补充RNA-seq流程 以前都是自己搭RNA-seq流程,虽然可以完成任务,但是数据量一多,批次多起来,就非常难管理。 既然别人提供了这么好的流程,那就要用起来,管理起来不是一般的轻松。 ENCODE-DCC/rna-seq-pipeline 安装比较麻烦,没有针对local的一键安装 ...
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing) 是2013年由斯坦福大学William J. Greenleaf和Howard Y. Chang实验室开发的用于研究染色质可及性 ...
DiffBind是基于peak的差异分析包,peaks由其他peak caller软件生成,如MACS2、HOMER.一个peak可能表示一个染色质开放区域、蛋白质结合位点等。call出来的peak是包含它的染色体、开始和结束位置信息的,然后可以通过bam文件根绝位置信息获取在peak上的read ...
最近项目要实现一种需求,对于后端返回给前端的json格式的一种规范,不允许缺少字段和字段值都为null,所以琢磨了一下如何进行将springboot的Jackson序列化自定义一下,先看看如何实现,再去看源码 第一步:写配置类 第二步:编写值为null时的自定义序列化 ...
三 Hive 自定义函数UDF和Transform 开篇提示: 快速链接beeline的方式: 1.自定义函数UDF 当Hive提供的内置函数无法满足你的业务处理需要时,此时就可以考虑使用用户自定义函数(UDF:user-defined function ...
颇多,需要一点耐心。 各种类型的数据可以直接在这个genome browser里浏览:http:// ...
表观遗传 表观遗传的3个机制:DNA甲基化;组蛋白修饰;chromatin remodeling 开放染色质测序: 参考:https://zhuanlan.zhihu.com/p/ ...
目前还没有达到自己满意的地步,魔方别人写的的,先提供参考,后面在加入新的东西 头文件 #ifndef TITLEBAR_H #define TITLEBAR_H #include & ...