#!/usr/bin/env python3#!-*- coding:UTF-8 -*- ...
背景 Kmer是基因组组装算法中经常接触到的概念,简单来说,Kmer就是长度为k的核苷酸序列。一般长短为m的reads可以分成m k 个Kmer。Kmer的长度和阈值直接影响到组装的效果。 Denovo组装流程:原始数据 数据过滤 纠错 kmer分析 denovo组装。 组装测序策略:根据基因组大小和具体情况选择个大概的k值,构建contig所需的数据量以及所需的构建的文库数量。对于植物基因组一般 ...
2020-05-13 15:28 0 717 推荐指数:
#!/usr/bin/env python3#!-*- coding:UTF-8 -*- ...
写程序我们经常会遇到需要遍历某一个目录下的所有文件这个操作,之前也写过很多用java实现的。但是java里面只能获取当前目录下列表,然后需要循环判断哪些是目录,哪些是文件,然后再进行文件夹的循环遍历,可以说相当麻烦。然而python有现成的库,只需要2个循环就可以搞定 ...
1. 2. ...
使用os.listdir() 函数来获取某个目录中的文件列表 import os names = os.listdir('somedir') 结果会返回目录中所有文件列表,包括所有文件,子目录,符号链接等等。如果你需要通过某种方式过滤数据,可以考虑结合os.path 库 ...
...
原文地址: https://blog.csdn.net/Scythe666/article/details/90262029 ...
#自定义函数: import ospath="D:\\Temp_del\\a"def gci (path): """this is a statement""" parents = os.listd ...