beta/or, se, p, zscore换算总结帖（20211014更新）
对GWAS的summary文件进行整合时，经常需要在beta，or, se, p, zscore之间进行换算，故在此总结一下。希望对大家有帮助。 1. se 计算 1.1 有 beta、p ，计算se； se=sqrt(((beta)^2)/qchisq(p,1,lower.tail=F ...
原文：beta，or, p value计算zscore
p value换算成zscore公式如下： pvalue就是P值，c就是zscore的绝对值。如果想知道zscore的正负，需要看or或者beta的值。如果or大于 beta大于 ，zscore为正值，如果or小于 beta小于 ，zscore为负值 如果自己懒得用公式计算，也可以利用ldsc计算zscore，具体参考链接：https: www.cnblogs.com chenwenyan p . ...
2020-05-07 16:50 0 1067 推荐指数：
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1. 有 beta、p ，计算se； 公式为：se=sqrt(((beta)^2)/qchisq(p,1,lower.tail=F)) 2. 有 or、p ，计算se； 公式为：se=abs(log(or)/qnorm(p/2)) 此外， beta等同于log（or）； qnorm ...
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