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经常会想到用热图来展示某个基因或某些基因的表达量问题,今天用R中pheatmap包一步步绘制热图。 第一步:公众路径设置,调用包pheatmap,读取目的文件,查看文件。 第二步:逐步深入绘制热图 图 图 一建热图 图 p lt pheatmap data 设置标准化方向scale,对其横向标准化 p lt pheatmap data,scale row 设置边框为白色,横向纵向聚类为无 bord ...
2020-06-06 21:04 0 4793 推荐指数:
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pheatmap实际上是 Pretty Heatmaps 的缩写,简单地来说,一个可以傻瓜式绘制聚类热图的R包。常用参数介绍基础设置main 图的名字file 要保存图的名字color 表示颜色,赋值渐变颜色调色板colorRampPalette属性,选择“绿,黑,红”渐变,分为100个等级,,例 ...
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