蛋白质序列位置特异性矩阵(PSSM)的获取
一、下载安装ncbi-blast（一定要是最新版本，在这里吃了苦头） 下载地址：https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATES ...
原文：蛋白质序列位置特异性矩阵(PSSM)的获取的准备工作：fasta序列的处理
由于获取位置特异性矩阵需要使用psiblast db swissprot query .txt evalue . num iterations out ascii pssm .pssm命令获取，然而该命令只对一个序列比对，如果把大量蛋白质序列输入，其结果会不断更新，最后得到最后那个序列的位置特异性矩阵，所以，需要对于蛋白质序列进行分割成多个文件 代码如下： 这里每个人蛋白质序列所用的长度不同，可根 ...
2020-04-25 21:49 0 746 推荐指数：
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