由于获取位置特异性矩阵需要使用psiblast -db swissprot -query 0.txt -evalue 0.001 -num_iterations 3 -out_ascii_pssm 0.pssm命令获取,然而该命令只对一个序列比对,如果把大量蛋白质序列输入,其结果会不断更新,最后 ...
一 下载安装ncbi blast 一定要是最新版本,在这里吃了苦头 下载地址:https: ftp.ncbi.nlm.nih.gov blast executables blast LATEST 安装blast:按照提示安装即可 这里我们要用到主要的文件为:rpsblast.exe 二 下载对比数据库 下载地址:ftp: ftp.ncbi.nlm.nih.gov blast db 这里可以选择nr ...
2020-04-25 21:47 0 3434 推荐指数:
由于获取位置特异性矩阵需要使用psiblast -db swissprot -query 0.txt -evalue 0.001 -num_iterations 3 -out_ascii_pssm 0.pssm命令获取,然而该命令只对一个序列比对,如果把大量蛋白质序列输入,其结果会不断更新,最后 ...
链特异性转录组测序 非链特异性转录组测序信息不包含链方向的特征信息,对正义和反义转录本无法准确判断,导致无法反映真实的转录情况。而链特异性转录组测序(strand-specific RNA seq)可以解决这个问题。链特异性建库的方式是在合成cDNA的第二条链时 ...
对链特异性建库的理解 2018年07月27日 01:21:03 sixu_9days 阅读数:650 标签: 链特异性建库LncRNA-seq 更多 个人分类: RNA-Seq ...
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一、氨基,羧基和氨基酸 氨基:-NH2 氨基是基本碱基,大多数含有氨基的有机物都有一定碱的特性。氨基是一个活性大、易被氧化的基团。 羧基:-COOH。分子中具有羧(念suo)基的化合物称为羧酸 ...
https://blog.csdn.net/dgyuanshaofeng/article/details/78686117 Sensitivity,我们常说“敏感性”、“灵敏性”、“召回率”或者“查 ...
目录 1.简介 2.安装运行 3.结果 1.简介 MSGF+也是近年来应用得比较多的蛋白鉴定软件。java写的,2008年初次发表JPR,2014年升级发表NC,免费开源,持续更新维护,良心软件。而且,有研究者对不同蛋白质组学鉴定软件进行比较分析 ...
参考文章http://www.biotrainee.com/thread-1465-1-1.html http://blog.sina.com.cn/s/blog_83f77c940102vny ...