原文:【MetDNA】基于代谢反应网络的大规模代谢物结构鉴定新算法

代谢是生命体内化学反应的总称,其所包含的代谢物变化规律可直接反映生命体的健康状态。非靶向代谢组学 untargeted metabolomics 可以在系统水平测量生命体内生理或病理状态下所有代谢物的含量变化,为研究其生物学机理提供依据。液相色谱 质谱联用 LC MS 技术是代谢组学研究的主要工具之一。为了能够将采集的质谱数据信息转变为有效的生物学信息,首先就必须对代谢峰进行代谢物的结构鉴定。然而 ...

2020-04-19 17:59 0 687 推荐指数:

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代谢组学】2.代谢物鉴定

代谢物鉴定流程 蛋白组比基因组和转录组落后一档次,代谢组学比蛋白组又落后一档次,仅化合鉴定就让人头疼。 流程如下: 化合精确质量数 数据库检索 一级鉴定(筛选分子量相同的离子)。解决质量数问题。 一级鉴定(通过同位素分布比对,筛选分子量和元素组成相同的离子)。解决 ...

Mon Dec 30 06:34:00 CST 2019 0 3067
代谢组学】2.代谢物鉴定

目录 代谢物鉴定流程 从谱图到峰表 代谢物鉴定流程 蛋白组比基因组和转录组落后一档次,代谢组学比蛋白组又落后一档次,仅化合鉴定就让人头疼。 流程如下: 化合精确质量数 数据库检索 一级鉴定(筛选分子量相同的离子 ...

Wed Dec 30 19:48:00 CST 2020 0 625
Python绘制药时曲线——母药和代谢物

有些药物本身不具有药理活性,进入体内后经代谢产生活性物质,也有一些药物,其自身与代谢物都具有药理活性,对于此类药物,我们需要关注它们的代谢物的浓度。 利用隔室模型进行研究时,步骤是根据隔室模型写出微分方程组,求出表达式,画图。对于常见的一室、二室、三室模型,药代动力学课本上都给出了血药浓度公式 ...

Sat Jul 27 00:47:00 CST 2019 0 493
antiSMASH数据库:微生物次生代谢物合成基因组簇查询和预测

2017年4月28日,核酸研究(Nucleic Acids Research)杂志上,在线公布了一个可搜索微生物次生代谢物合成基因组簇的综合性数据库antiSMASH数据库 4.0版,前3版年均引用250次,累计引物1600+;可实现基因组与基因组之间的相关天然产物合成基因簇的查询和预测 ...

Wed Aug 02 05:46:00 CST 2017 0 1296
代谢组学】4.生物标志分析

概念 生物标志,即传说中的biomarker,是一类可测量的,用来表征疾病状态的物质,通常用于表征: 疾病的状态(是否为某种疾病/某种亚型); 药物敏感性,用于用药指导; 生理状态监测。 类型 预后指标 预测疾病的预后效果(独立于治疗),如AB1-42可用于诊断 ...

Fri Jan 03 06:35:00 CST 2020 0 3626
代谢组学】4.生物标志分析

目录 概念 类型 效果评价 多变量ROC分析 验证 分析工具 概念 生物标志,即传说中的biomarker,是一类可测量的,用来表征疾病状态的物质,通常用于表征: 疾病的状态(是否为某种疾病/某种亚型); 药物敏感性,用于用药 ...

Wed Dec 30 19:51:00 CST 2020 0 619
人体的物质代谢和能量代谢

简述 物质代谢是指机体和周围环境之间不断进行物质交换的过程,他包括合成代谢和分解代谢: 合成代谢:机体不断的从外界摄取营养物质,并在能量存在的情况下将其转化为自身物质的过程。 分解代谢:机体把自己的物质不断的进行分解,并释放能量的过程 物质代谢 物质代谢主要包括糖代谢、蛋白质代谢、和脂肪 ...

Wed Jul 22 15:11:00 CST 2020 0 618
 
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