GWAS: 曼哈顿图，QQ plot 图，膨胀系数（ manhattan、Genomic Inflation Factor）
画曼哈顿图和QQ plot 首推R包“qqman”，简约方便。下面具体介绍以下。 一、画曼哈顿图 install.packages("qqman") library(qqman) 1、准备包含SNP, CHR, BP, P的文件gwasResults ...
原文：使用qqman对曼哈顿图（Manhattan plot ）多个显著位点标志不同颜色，拒绝屎一样的绿色
欢迎来到 bio生物信息 的世界 之前的推文GWAS: 曼哈顿图，QQ plot 图，膨胀系数 manhattan Genomic Inflation Factor 写过如何用qqman包做曼哈顿图。 但众所周知 据我说知 ，这个包画图很丑，尤其想highlight显著位点时，屎一样的绿色让人一言难尽。 这话不是我说是，是下面这位小伙子说的 此外，该包还有一个明显缺点，只能highlight一个显 ...
2020-04-17 23:06 0 2094 推荐指数：
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