原文:蛋白质结构模建初探

目录 相关链接 蛋白质模建的几种方法 同源模建 折叠识别 从头预测 综合方法 实地操作 amp 预测结果 路线 预测结果 Swiss pGen Threader QUARK I TASSER 蛋白质预测结果评分 PDB文件的检验 预测质量检验 人工结果检验 RMSD Root mean square deviation 计算结果 查询SPIKE蛋白的结合蛋白 APN蛋白 的相关蛋白 Dock的简 ...

2020-04-16 23:19 0 592 推荐指数:

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蛋白质结构模型和功能预测:Swiss-model工具的使用

Swiss-model也是一款预测蛋白质结构模型的工具。网页地址:https://swissmodel.expasy.org/ 首先,进行常规的注册后,点击start modelling 以搜索BRCA1蛋白质为例: 进入NCBI的protein网页:https ...

Sat Dec 02 01:07:00 CST 2017 0 10979
1、蛋白质二级结构预测方法

原创 2017-05-08 omicshare.com 基迪奥生物 蛋白质二级结构的预测通常被认为是蛋白结构预测的第一步,二级结构是指α螺旋和β折叠等规则的蛋白质局部结构元件。不同的氨基酸残基对于形成不同的二级结构元件具有不同的倾向性。按蛋白质中二级结构的成分可以把球形蛋白分为全 ...

Thu Jun 15 22:32:00 CST 2017 0 11882
AI 预测蛋白质结构「GitHub 热点速览 v.21.29」

作者:HelloGitHub-小鱼干 虽然 AI 领域藏龙卧虎,但是本周预测蛋白质结构的 alphafold 一开源出来就刷爆了朋友圈,虽然项目与我无关,但是看着科技进步能探寻到生命机理,吃瓜群众也有点小激动。虽然不能参与这个了不起的项目,但是我们可以手持编程书籍参与 ...

Tue Jul 20 17:12:00 CST 2021 0 453
氨基酸,多肽,蛋白质

一、氨基,羧基和氨基酸 氨基:-NH2 氨基是基本碱基,大多数含有氨基的有机物都有一定碱的特性。氨基是一个活性大、易被氧化的基团。 羧基:-COOH。分子中具有羧(念suo)基的化合物称为羧酸。 氨基酸,结构中含有胺基和羧基,并且胺基和羧基都是直接连接在一个-CH-结构上的有机化合 ...

Mon Jul 26 07:36:00 CST 2021 0 318
【4】蛋白质组学鉴定软件之MSGFPlus

目录 1.简介 2.安装运行 3.结果 1.简介 MSGF+也是近年来应用得比较多的蛋白鉴定软件。java写的,2008年初次发表JPR,2014年升级发表NC,免费开源,持续更新维护,良心软件。而且,有研究者对不同蛋白质组学鉴定软件进行比较分析 ...

Sat Aug 29 01:53:00 CST 2020 0 836
Diamond软件比对蛋白质数据库

参考文章http://www.biotrainee.com/thread-1465-1-1.html http://blog.sina.com.cn/s/blog_83f77c940102vny ...

Thu Feb 01 01:56:00 CST 2018 0 1231
蛋白质组学实验设计、质控与分析

1. 实验设计与技术路线 (1) 常用流程 流程 说明 1.材料收集 细胞、细胞上清、组织、血浆、血清、脑脊液、外泌体、尿液...... 2.定量技术 蛋白组:iTRAQ/TMT ...

Thu Jan 16 05:19:00 CST 2020 0 2942
 
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