GTEx数据库
GTEx database：该数据库是健康人贡献的组织的RNASeq的数据。还有snp信息。将snp信息与gene的表达水平结合起来。 donor： donor贡献的tissue。 gene表达水平（用FPKM表示gene的表达水平）受其周围snp的影响，这样的gene ...
原文：基于MatrixEQTL进行eQTL mapping analysis——以GTEx数据库为例
MatrixEQTL是一个快速有效的cis trans eQTL mapping分析工具，被The Genotype Tissue Expression GTEx 数据库用于eQTL mapping分析。使用MatrixEQTL进行eQTL mapping需要五个输入文件，即SNP.txt snpmatrix文件，行名为样本名称，列名为snpid ， GE.txt 基因表达量文件，行名为样本名称， ...
2020-04-12 22:49 0 1868 推荐指数：
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首先QTL是数量性状位点，比如身高是一个数量性状，其对应的控制基因的位点就是一个数量性状位点，而eQTL就是控制数量性状表达位点，即能控制数量性状基因（如身高基因）表达水平高低的那些基因的位点。 数量性状基因座：控制数量性状的基因在基因组中的位置称数量性状基因座。常利用DNA分子标记技术对这些区域 ...
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