TCGA | CCLE | 数据挖掘基本教程 | GTEx
2023年05月02日 还好没有走上纯生信的灌水之路，要扎扎实实的搞干湿结合，只有问题问好了、实验设计好了、数据测好了，生信才能迸发出高能的威力！ TCGA数据下载 基本的TPM表达数据 全网最全！TCGA新版数据下载与整理教程来了！来抄作业！ 单基因泛癌|CCLE数据下载 ...
原文：GTEx数据库-TCGA数据挖掘的好帮手
转自生信菜鸟团,如有侵权j,请联系微信:biozhangz进行删除. GTEx数据库 TCGA数据挖掘的好帮手 Posted on 年 月 日 通常我们在挖掘TCGA数据库的时候，会发现该项目纳入的正常组织测序结果是非常少的，也就是说很多病人都不会有他的正常组织的转录组测序结果，比如说乳腺癌吧， 个左右的转录组数据，其中 左右都是肿瘤组织的测序数据，只有区区 个左右的正常对照。 这个时候我们就需要 ...
2020-04-11 18:45 0 1861 推荐指数：
相关推荐
数据库的两个好帮手：pagehack和pg_xlogdump
摘要：pagehack和pg_xlogdump可以帮助我们在数据库故障定位中，解析各种文件的页面头和xlog日志。 随着技术的演进，数据也发生了巨大的变化，数据规模越来愈大、数据种类呈现多样性，数据处理的时效性要求也越来越高，GaussDB(DWS)实时数仓当前面临着巨大的机遇 ...
GTEx数据库
GTEx database：该数据库是健康人贡献的组织的RNASeq的数据。还有snp信息。将snp信息与gene的表达水平结合起来。 donor： donor贡献的tissue。 gene表达水平（用FPKM表示gene的表达水平）受其周围snp的影响，这样的gene ...
TCGA数据挖掘 | 免疫细胞浸润分析
问题： 什么是免疫细胞浸润？ 肿瘤组织里都有哪些细胞？有哪些免疫细胞？ 免疫细胞浸润分析的基本原理？相关性 bulk RNA-seq拆分scRNA-seq的原理 免疫浸润评估常 ...
运营好帮手| 华为DTM助电商类应用实现营销数据快速跟踪
对于电商来说，销售额就是生命线，业务运营人员需要实时关注订单量，交易额，支付转化率等，并从各种维度对比分析，无论增幅或降幅，都需要马上找到原因，落地运营手段进行干预。快速准确的得到各种营销数据就显得格外重要，这就对数据的时效性提出了极大要求，且随着业务的不断发展，活动不断变换，运营人员就需要不断地 ...
TCGA系列--TCGA可视化数据库GEPIA
中国大牛力作 张泽民： http://gepia.cancer-pku.cn/index.html http://cancer-pku.cn/ ...
TCGA一些数据库
最出名，http://www.cbioportal.org/ 特色：最基本的简单分析基因突变、共表达/共突变的基因，下载数据也可以，最常看的应该还是oncoPrint那个。 详细用法：TCGA数据库的数据怎么查？ 最方便，Ge-mini 特色：手机app，可随时查看，主要关注基因表达 ...
基于MatrixEQTL进行eQTL mapping analysis——以GTEx数据库为例
MatrixEQTL是一个快速有效的cis/trans eQTL mapping分析工具，被The Genotype-Tissue Expression (GTEx)数据库用于eQTL mapping分析。使用MatrixEQTL进行eQTL mapping需要五个输入文件，即SNP.txt ...