简单使用DESeq2/EdgeR做差异分析
简单使用DESeq2/EdgeR做差异分析 Posted: 五月 07, 2017 Under: Transcriptomics By Kai no Comments DESeq2和EdgeR都可用于做基因差异表达分析，主要也是用于RNA-Seq数据，同样也可以处理类似 ...
原文：limma, edgeR, deseq2,genefilter计算差异R包的foldchange方法差别
差异计算对应生信分析非常重要 limma,genefilter 包计算差异,数据一定要转log, 因为 这两个包计算差异使用的方法是 mean As mean Bs , 也计算是 logAmean logBmean log Amean Bmean 这也是为什么这两个包算出来的结果直接是logfoldchange . deseq 包计算差异使用的是raw readscount,整数数据类型,计算差 ...
2020-04-10 23:55 0 992 推荐指数：
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